Perbedaan Antara Transposon dan Retrotransposon

Transposon vs Retrotransposon

Transposon dan retrotransposon adalah komponen genetik dari DNA, dan ada perbedaan besar di antara mereka. Persentase kehadiran bahan genetik ini bervariasi antar spesies, dan fungsinya menentukan nasib organisme dengan mutasi dan perubahan penting lainnya secara fenotip. Transposon dan retrotransposon adalah gen atau kumpulan gen tertentu yang terletak di untai DNA, dan perubahan lokasi mereka telah menjadi penyebab utama konsekuensi ini. Namun, artikel ini bermaksud membahas fungsi gen-gen ini secara singkat dan menyajikan perbandingan antara transposon dan retrotransposon..

Apa itu Transposon??

Transposon adalah fragmen atau segmen DNA yang menarik dengan kemampuan untuk mengubah lokasi untai DNA dalam bentuk mekanisme cut and paste. Karena sifat transposon yang mobile ini, ini dikenal sebagai gen pelompat. Transposon adalah dua tipe utama yang dikenal sebagai Transposon Kelas I dan Transposon Kelas II. Biasanya, tipe Kelas II disebut sebagai transposon dan tipe Kelas I disebut sebagai retrotransposon. Proses memotong dan menempel segmen DNA seluler diatur oleh transposase enzim. Enzim mengikat ke kedua ujung transposon dan memotong ikatan fosfodiester dari untai DNA, mengisolasi transposon, memindahkannya ke situs target, dan mengikat di lokasi baru. Namun, proses ini menarik untuk dipahami, karena beberapa transposon hanya dapat pindah ke lokasi tertentu hanya karena ketidakcocokan urutan dasar dengan situs target. Gen dengan satu ujung untai tunggal memiliki urutan basa yang sama dengan ujung lain untai tunggal lainnya adalah transposon dengan tepi lengket, karena mereka dapat mengikat ke lokasi untai DNA target dengan urutan basa yang sama seperti pada ujung lengket . Namun, mobilitas gen ini dapat menyebabkan perubahan genotipe dan juga fenotipe organisme. Para ilmuwan menemukan tentang transposon dan makanan yang dimodifikasi secara genetik dan organisme sesuai dengan penyesuaian yang disukai kemudian disediakan. Tanaman pertanian yang sangat produktif, antibiotik dengan sifat obat, hewan ternak adalah beberapa produk yang dikembangkan secara menguntungkan setelah penemuan transposon oleh Barbara McClintock pada tahun 1940-an.

Apa itu Retrotransposon?

Retrotransposon adalah transposon Kelas I, dan ini bergerak melalui genom melalui mekanisme salin dan tempel. Mekanisme mobilitas retrotransposon melibatkan beberapa langkah besar seperti menyalin segmen gen untai DNA ke RNA, transfer salinan RNA ke situs target, transkripsi urutan RNA kembali ke DNA menggunakan reverse transcriptase, dan penyisipan dari gen ke lokasi baru untai DNA genom. Kedua ujung retrotransposon ini biasanya memiliki terminal berulang yang panjang dengan sekitar 1000 pasangan basa, dan itu digunakan sebagai fitur identifikasi gen-gen ini. Gen-gen ini mudah diamplifikasi di dalam genom, dan persentase retrotransposon dalam genom manusia adalah sekitar 50%. Ini bisa sangat berbahaya karena virus penyebab AIDS, HIV, dan virus leukemia sel-T memiliki retrotransposon dalam genom RNA mereka. Faktanya, virus-virus ini dapat mengikat retrotransposon ke situs manapun dari untai DNA manusia dengan menggunakan reverse transcriptase dan integrase. Enzim integrase berfungsi dengan cara yang sama seperti transposase pada transposon Kelas II.