Ribonukleas adalah nuklease yang secara khusus mendegradasi RNA menjadi unit yang lebih kecil. Mereka dapat dibagi menjadi dua kategori; endoribonucleases dan exoribonucleases. Endoribonuclease adalah endonuclease yang dapat menurunkan RNA untai tunggal atau ganda. Ini memotong ikatan fosfodiester dalam rantai polynucleotide RNA. Contohnya adalah RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P dan RNase H. Exoribonuclease adalah eksonuclease yang terdegradasi RNA dengan menghilangkan nukleotida terminal dari 5'end atau 3'end dari molekul RNA. Contohnya adalah RNase R, RNase II, RNase D dan RNase PH. Itu perbedaan utama antara RNASE A dan RNASE H adalah bahwa RNase A adalah ribonuklease pankreas yang secara spesifik mendegradasi RNA untai tunggal menjadi komponen yang lebih kecil, sedangkan RNase H adalah enzim non-spesifik yang memotong RNA dalam hibrid RNA-DNA menjadi unit yang lebih kecil melalui mekanisme hidrolitik.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu RNASE A
3. Apa itu RNASE H
4. Kesamaan Antara RNASE A dan RNASE H
5. Perbandingan Berdampingan - RNASE A vs RNASE H dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
RNase A adalah ribonuklease pankreas yang secara khusus membelah residu sitosin dan urasil yang tidak berpasangan pada ujung RNA untai tunggal 3 '. RNase H bekerja pada konsentrasi garam yang lebih tinggi (0,3M atau konsentrasi NaCl yang lebih tinggi). Reaksi hidrolitik adalah dua langkah. Ini membentuk 3 'produk terfosforilasi melalui perantara siklik monofosfat 2', 3 '. Meskipun spesifik untuk RNA untai tunggal pada konsentrasi garam yang lebih tinggi, juga dapat menurunkan RNA untai ganda dan RNA dalam hibrida RNA-DNA pada konsentrasi NaCl yang lebih rendah (lebih rendah dari NaCl 0,3M).
Bruce Merrifield pertama kali mensintesis enzim ini. RNase A adalah enzim yang sangat populer dalam penelitian molekuler. Bovine pancreatic RNase A adalah contoh dari RNase A. Dan itu adalah salah satu enzim paling keras yang digunakan di laboratorium. Enzim ini tidak membutuhkan kofaktor untuk aktivitasnya. Ini adalah enzim yang sangat termostabil. RNase A adalah enzim pertama dan protein ketiga yang urutan asam aminonya terdeteksi. Enzim ini sangat kecil dengan 124 asam amino dan massa molekul 12600da. Dan ia memiliki empat residu Histidine (His 12 dan His 119 yang terlibat dalam reaksi katalitik).
Gambar 01: The RNase A
RNase A dapat diisolasi dengan merebus sampel kasar. Ketika mendidih, semua enzim lain menurunkan sisa RNase A. RNase A adalah enzim yang luar biasa stabil. Enzim ini menghambat dengan protein inhibitor ribonuklease, logam berat dan kompleks vanadat uridin.
RNase H adalah enzim ribonuklease spesifik yang tidak spesifik yang dapat mendegradasi RNA dalam hibrid RNA-DNA melalui reaksi hidrolitik. RNase H memecah ikatan RNA-DNA 3'- dalam hibrida RNA-DNA. Pada akhirnya menghasilkan produk terminasi 3'OH dan 5 'fosfat. Dalam replikasi DNA itu memainkan peran penting dengan menghapus RNA primer setelah untai DNA baru terbentuk. Dalam kondisi laboratorium, ia secara khusus mendegradasi RNA dalam hibrid RNA-DNA tetapi bukan DNA dan RNA yang tidak dikabridisasi. Dan enzim ini biasanya digunakan untuk menghancurkan template RNA setelah untai DNA komplementer pertama terbentuk selama sintesis cDNA.
Gambar 02: RNase H
RNase H juga menggunakan tes perlindungan nuclease. Ini juga dapat dimasukkan ke dalam penghapusan ekor poli A dari mRNA. RNase H memiliki kemampuan untuk menghancurkan RNA non-coding di dalam dan di luar sel. Ion logam diperlukan sebagai kofaktor untuk aktivitas protein ini. Chelator (EDTA) dapat digunakan untuk menghambat enzim RNase H.
RNASE A vs RNASE H | |
RNase A adalah ribonuklease pankreas yang secara khusus membelah ujung sitosin dan urasil 3 'tidak berpasangan dari RNA untai tunggal pada konsentrasi garam yang lebih tinggi. | RNase H adalah enzim ribonuklease nonspesifik yang dapat mendegradasi RNA dalam hibrid RNA-DNA melalui reaksi hidrolitik. |
Sifat RNA Cleaving | |
RNase A secara khusus memotong RNA untai tunggal pada konsentrasi garam yang lebih tinggi. | RNase H memotong RNA dalam RNA-DNA hybrid. |
Kebutuhan Co-faktor untuk Kegiatan | |
RNase A tidak memerlukan kofaktor untuk aktivitasnya. | RNase H membutuhkan ion logam sebagai kofaktor untuk aktivitasnya. |
Penghambat Aktivitas Protein | |
Kompleks protein ribonuklease inhibitor, logam berat, dan uridin vanadat menghambat aktivitas RNAse A.. | Chelator (EDTA) menghambat aktivitas RNase H. |
Penghapusan RNA Primer dalam Replikasi DNA | |
RNase A tidak digunakan untuk menghilangkan primer RNA dalam replikasi DNA. | RNase H digunakan untuk menghilangkan primer RNA dalam replikasi DNA |
Penghapusan Templat DNA dalam Sintesis DNA Pelengkap (C-DNA) | |
RNase A tidak digunakan untuk menghilangkan template RNA selama sintesis DNA komplementer (C-DNA). | RNase H digunakan untuk menghilangkan template RNA selama sintesis DNA komplementer (C-DNA). |
Penghapusan Ekor-A-Ekor pada mRNA Hibridisasi ke Oligo (dt) | |
RNase A tidak digunakan untuk menghilangkan "poly-A tail" di mRNA yang dipadukan ke oligo (dt). | RNase H digunakan untuk menghilangkan "poly-A tail" di mRNA yang disatukan dengan oligo (dt) |
Ribonucleases adalah enzim nuklease yang memiliki kemampuan untuk memecah RNA menjadi unit yang lebih kecil. Mereka adalah dua jenis; endoribonucleases dan exoribonucleases. Endoribonuklease adalah endonuklease yang memiliki kemampuan untuk menurunkan RNA untai tunggal atau untai ganda. Dan itu memotong ikatan fosfodiester dalam rantai polynucleotide RNA. RNase A dan RNase H adalah dua endoribonukleas. RNase A adalah ribonuklease pankreas yang secara khusus membelah residu sitosin dan urasil yang tidak berpasangan pada ujung RNA untai tunggal dengan konsentrasi garam yang lebih tinggi. RNase H adalah enzim ribonuklease spesifik yang dapat menurunkan RNA dalam hibrid RNA-DNA melalui reaksi hidrolitik. Ini adalah perbedaan antara RNase A dan RNase H.
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara RNASE A dan RNASE H
1.Karuturi, Penulis Amrutha. "17 perlu tahu fakta tentang RNase A." AG Blog, 22 Februari 2017. Tersedia di sini
2. "Harap ribon." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 Jan 2018. Tersedia di sini
1.'RNase A'By Tidak ada penulis yang bisa dibaca mesin. Vossman diasumsikan (berdasarkan klaim hak cipta)., (CC BY-SA 2.5) melalui Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Tidak ada penulis yang bisa dibaca mesin. Vossman diasumsikan (berdasarkan klaim hak cipta)., (CC BY-SA 2.5) melalui Commons Wikimedia