Differkinome

Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik

Sains & Alam
Share

Perbedaan Utama - Proteomik vs Transkriptomik
  

Teknologi omic adalah tren saat ini, di mana biomolekul yang berbeda dari suatu organisme dipandang sebagai koleksi keseluruhan berkaitan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi omic memiliki beragam aplikasi. Omics yang berbeda dari sampel biologis meliputi genomik, proteomik, transkriptomik, dan metabolomik. Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. Ini didefinisikan sebagai himpunan semua protein yang diekspresikan dalam suatu organisme, sifat struktural dan fungsionalnya. Set lengkap protein, oleh karena itu, membentuk proteom. Transkriptomik adalah studi lengkap dari semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup. Dengan demikian, transkriptomik berhubungan dengan gen yang secara aktif diekspresikan dalam organisme hidup. Seperangkat mRNA total dalam organisme hidup disebut sebagai transkriptome. Itu perbedaan utama antara Proteomik dan Transkriptomik didasarkan pada jenis biomolekulnya. Dalam proteomik, set total protein yang diekspresikan dalam organisme hidup dipelajari sedangkan, dalam transkriptomik, total mRNA dari organisme hidup dipelajari.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Proteomik?
3. Apa itu Transkriptomik
4. Kesamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
5. Perbandingan Berdampingan - Proteomik vs Transkriptomik dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Proteomik??

Istilah proteomik diciptakan pada tahun 1995 dan pada awalnya didefinisikan sebagai pelengkap protein total dalam sel, jaringan atau organisme. Dengan kemajuan dalam studi proteomik, itu kemudian dimodifikasi untuk dianggap sebagai istilah umum di mana banyak bidang studi dimasukkan. Saat ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, modifikasinya, penerapannya dan pentingnya protein dipelajari. Oleh karena itu, banyak penelitian dilakukan di bidang proteomik saat ini.

Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan ini, para ilmuwan beralih ke karakterisasi total kandungan protein pada hewan seperti marmut dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Aplikasi Proteomics

Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik, karena protein adalah molekul yang mengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis protein. Dengan demikian, studi tentang seluruh protein dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Beberapa aplikasi adalah;

  1. Anotasi genom: Dengan mempelajari kandungan protein suatu organisme, genom yang tepat yang bertanggung jawab atas senyawa protein aktif dapat ditentukan. Dalam skenario ini hasil dari semua genomik, Transkriptomik dan proteomik adalah penting.
  2. Identifikasi penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam identifikasi kondisi penyakit, dengan membandingkan yang sehat dan yang sakit
  3. Untuk dilakukan ekspresi protein dipelajari selama eksperimen.
  4. Modifikasi protein dan studi interaksi: Untuk menggunakan protein dalam vitro kondisi atau dan in vivo kondisi, untuk menentukan kondisi penyimpanan protein yang diekstraksi ini dan untuk mempelajari perilaku protein di in vitro, in vivo dan metode in - silico.

Gambar 01: Proteomik

Ada berbagai teknik yang terlibat dalam proteomik

  1. Ekstraksi protein total dan memisahkan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga dapat dipisahkan menggunakan Kromatografi Cair Kinerja Tinggi (HPLC).
  2. Sekuensing protein yang diekstraksi menggunakan metode seperti metode sekuensing Edmund atau spektrometri massa.
  3. Setelah sekuens diidentifikasi, sifat struktural dan fungsional dari konten protein dianalisis menggunakan perangkat lunak berbasis komputer dan alat bioinformatika.

Apa itu Transkriptomik?

Istilah transkriptom diciptakan baru-baru ini. Transkriptomik adalah studi tentang kandungan mRNA total dari suatu organisme. MRNA total adalah DNA yang diekspresikan dalam organisme atau sel yang hidup. Koleksi lengkap mRNA disebut sebagai transkriptome.

Langkah-langkah menuju menganalisis transkriptome termasuk,

  1. Ekstraksi RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel kolom dengan manik-manik poli DT.
  2. Urutan mRNA dilakukan.

Teknologi microarray adalah salah satu cara umum untuk mengidentifikasi transkripom suatu organisme. Teknik microarray melibatkan pelat probe dengan untaian pelengkap transkriptome. Setelah hibridisasi, mRNA yang ada dalam organisme atau sel dapat dikarakterisasi.

Gambar 02: Teknik Transkriptomik

Transkriptomik sekarang banyak digunakan di bidang medis. Diagnosis penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama tempat Transkriptomik digunakan. Dengan menganalisis transkriptom suatu organisme, mRNA asing dapat diidentifikasi, dan jika ada infeksi, itu dapat diidentifikasi. RNA non-coding dapat dipisahkan menggunakan teknologi transkriptomik. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan lingkungan yang berbeda dapat dipantau.

 Apa Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?

  • Keduanya merupakan bagian dari konsep teknologi omic.
  • Keduanya digunakan dalam diagnosa penyakit dan karakterisasi penyakit suatu organisme.
  • Kedua area studi melibatkan ekstraksi biomolekul, pemisahan biomolekul dan langkah-langkah pengurutan.

Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?

Protemik vs Transkriptomik
Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. Transkriptomik adalah studi lengkap dari semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup.
Jenis Molekul Bio yang Dipelajari 
Protein dipelajari dalam proteomik. mRNA dipelajari dalam transkriptomik.
Faktor yang Dipelajari
Struktur, fungsi, interaksi, modifikasi dan aplikasi protein dipelajari dalam proteomik. Struktur urutan, interaksi dengan lingkungan dan aplikasi mRNA dipelajari dalam transkriptomik.

Ringkasan - Proteomik vs Transkriptomik 

Omics memainkan peran penting dalam bidang ilmu kehidupan. Proteomik mengacu pada studi tentang proteome yang membentuk koleksi lengkap protein dalam sel atau organisme. Transkriptomik mengacu pada studi transkriptome yang merupakan set lengkap dari DNA yang diekspresikan yang dalam bentuk mRNA. Dua bidang studi, proteomik dan transkriptomik, diturunkan setelah pengenalan genomik dan saat ini digunakan secara luas dalam diagnostik medis dan dalam karakterisasi dan penyaringan organisme. Inilah perbedaan antara proteomik dan transkriptomik.

Unduh PDF Proteomics vs Transcriptomics

Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini: Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik

Referensi:

1.Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. "Teknologi 'Omic': genomik, transkriptomik, proteomik, dan metabolomik." Ahli Obstetri & Ginekologi, Blackwell Publishing Inc, 18 Juli 2011. Tersedia di sini  
2.Graves, Paul R., dan Timothy A. J. Haystead. "Panduan Biologi Molekuler untuk Proteomik." Ulasan Mikrobiologi dan Biologi Molekuler, American Society for Microbiology, Maret 2002. Tersedia di sini
3. Rendah, Rohan, dkk. "Teknologi transkriptomik." Biologi Komputasi PLoS, Perpustakaan Ilmu Pengetahuan Umum, Mei 2017. Tersedia di sini  

Gambar milik:

1.'Proteomics'Dengan Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggris - Ditransfer dari en.wikibooks ke Commons., (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2.'Microarray dan sequencing flow cell'Dengan Thomas Shafee - Pekerjaan sendiri, (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia

Sains & Alam
×