Perbedaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Itu perbedaan utama antara proteomik dan metabolomik adalah itu proteomik adalah studi tentang semua protein suatu organisme sedangkan metabolomik adalah studi tentang semua metabolit suatu organisme.

Genomik adalah studi tentang susunan genetik suatu organisme. Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omik terkait dengan genomik. Proteom mengacu pada semua protein dalam sel atau organisme. Metabolom, di sisi lain, mengacu pada semua metabolit suatu organisme. Dengan demikian, studi tentang proteom adalah proteomik sedangkan studi tentang metabolom adalah metabolomik. Proteomik dan metabolomik keduanya penting dalam diagnostik penyakit dan dalam karakterisasi dan penyaringan organisme. Selain itu, keduanya terhubung dalam banyak aspek biologi sel, terutama dalam pensinyalan sel, degradasi protein dan generasi dan modifikasi pasca-translasi..

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Proteomik?
3. Apa itu Metabolomik?
4. Kesamaan Antara Proteomik dan Metabolomik
5. Perbandingan Berdampingan - Proteomik vs Metabolomik dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Proteomik??

Proteom adalah pelengkap protein total dalam sel, jaringan atau organisme. Oleh karena itu, proteomik adalah studi tentang proteom suatu organisme. Dalam proteomik, karakteristik protein yang berbeda dianalisis. Oleh karena itu, proteomik terutama berfokus pada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, modifikasi, aplikasi dan pentingnya protein. Itulah sebabnya banyak proyek penelitian dilakukan di bidang proteomik saat ini.

Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan proyek ini, para ilmuwan beralih ke karakterisasi kandungan protein total pada hewan seperti marmut dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik karena protein adalah molekul yang mengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis protein. Dengan demikian, studi tentang seluruh protein dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Selain itu, proteomik memiliki banyak aplikasi dalam anotasi genom, identifikasi penyakit dan diagnostik, melakukan studi ekspresi protein selama percobaan dan modifikasi protein dan studi interaksi, dll..

Gambar 01: Proteomik

Ada berbagai teknik yang terlibat dalam proteomik, termasuk ekstraksi protein total, pemisahannya menggunakan elektroforesis gel 2D, sekuensing protein yang diekstraksi menggunakan metode seperti metode sekuensing Edmund atau spektrometri massa dan analisis sifat struktural dan fungsional dari protein menggunakan perangkat lunak dan alat bioinformatika berbasis komputer.

Apa itu Metabolomik??

Metabolomik adalah studi tentang semua metabolit dalam sel, jaringan atau organisme. Ini termasuk identifikasi dan kuantifikasi metabolit seluler menggunakan berbagai alat analisis dan statistik canggih. Metabolomik adalah studi penting karena mengungkapkan informasi mengenai metabolisme suatu organisme.

Gambar 02: Metabolomics

Untuk mempelajari substrat dan produk dari reaksi metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analitis. Spektrometri massa menghasilkan metabolit dan konsentrasinya, mencerminkan keadaan biokimia sel atau jaringan yang sebenarnya. Oleh karena itu, metabolomik dapat dianggap sebagai representasi terbaik dari fenotip molekul suatu organisme. Selain itu, metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan dari proteomik karena sebagian besar metabolit dihasilkan karena aktivitas enzim yang merupakan protein..

Apa Persamaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

• Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omik terkait dengan genomik.
• Metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan dari proteomik.
• Proteom dan metabolisme sangat terkait dengan banyak penelitian.

Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

Proteomik adalah studi skala besar tentang protein termasuk struktur dan fungsinya, di dalam sel atau organisme. Sementara itu, metabolomik adalah studi tentang profil metabolit dalam sel, jaringan atau organisme di bawah serangkaian kondisi tertentu. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutama menyangkut set lengkap protein sedangkan metabolomik terutama menyangkut set lengkap metabolit, termasuk beragam molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik dari senyawa eksogen, dll. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan lain antara proteomik dan metabolomik.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.

Ringkasan - Proteomik vs Metabolomik

Organisme hidup dapat dipelajari menggunakan genom, protein, dan metabolitnya. Genomik, proteomik, dan metabolomik adalah tiga area yang masing-masing mempelajari susunan genetik, protein, dan metabolit sel atau organisme. Proteomik penting karena merupakan cerminan dinamis dari gen dan lingkungan. Metabolomik sangat penting karena secara langsung mencerminkan status saat ini dari reaksi biokimia sel atau status metabolisme suatu organisme. Dengan demikian, ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.

Referensi:

1. P, Surat. "Bagaimana Metabolom dan Proteom Terkait?" Berita, 26 Februari 2019, Tersedia di sini.
2. Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. "SAC Review 'Omic' Technologies: Genomics, Transcriptomics, Proteomics dan Metabolomics." Kebidanan dan Kandungan, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 Juli 2011, Tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Proteomics" Oleh Xxl7441 di English Wikibooks - Ditransfer dari en.wikibooks ke Commons. (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2. "Skema Metabolomik" Oleh Lmaps (bicara) - Saya membuat karya ini sepenuhnya sendirian (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia