Perbedaan Antara Probe dan Primer

Perbedaan Utama - Probe vs Primer
 

Probe molekuler adalah fragmen DNA atau RNA kecil yang mengenali urutan komplementer dalam DNA atau RNA dan memungkinkan identifikasi urutan target. Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal untuk sintesis DNA. Primer dan probe hibridisasi dengan nukleotida komplementer dari DNA templat atau DNA target. Namun, perbedaan utama antara probe dan primer adalah itu Primer diperlukan untuk replikasi DNA sementara probe diperlukan untuk mendeteksi urutan spesifik dalam DNA sampel.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Probe
3. Apa itu Primer
4. Perbandingan Berdampingan - Probe vs Primer
5. Ringkasan

Apa itu Probe?

Probe adalah fragmen kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mendeteksi DNA target atau RNA dalam sampel dengan hibridisasi molekuler. Mereka juga dikenal sebagai penanda molekuler. Panjang probe dapat bervariasi (100 hingga 1000 basa), dan nukleotida probe saling melengkapi dengan bagian dari urutan target. Untuk memudahkan deteksi, probe diberi label dengan isotop radioaktif atau dengan pewarna atau antibodi fluoresen. Probe mengikat dengan basis komplementer dari urutan target dan mengungkapkan keberadaan DNA target atau RNA dalam sampel. Ada dua metode utama pelabelan probe: akhiri pelabelan dan terjemahan nick. Probe dikategorikan ke dalam berbagai jenis termasuk probe DNA, probe RNA, probe cDNa dan probe oligonukleotida sintetis, dan mereka disiapkan menggunakan teknik yang berbeda.

Probe adalah alat penting dalam banyak bidang mikroba dan molekuler seperti virologi, patologi forensik, pengujian ayah, sidik jari DNA, deteksi penyakit genetik, RFLP, sitogenetika molekuler, di situ hibridisasi, dll.

Gambar 01: Probe berlabel fluoresensi yang digunakan dalam IKAN untuk deteksi patogen

Apa itu Primer?

Primer adalah fragmen DNA atau RNA pendek yang berfungsi sebagai inisiator untuk sintesis DNA. Enzim DNA polimerase menambahkan nukleotida ke kelompok 3 'OH dari sekuens primer dan mensintesis untai baru yang komplementer pada DNA templat. Primer adalah fragmen yang sangat pendek dengan panjang 18 hingga 20 nukleotida. Mereka disintesis secara kimia di laboratorium untuk in vitro Amplifikasi DNA (PCR). Primer dapat memiliki urutan nukleotida apa pun karena dirancang oleh pengguna. Mereka disintesis agar sesuai dengan basis pelengkap dari DNA templat. Oleh karena itu, dapat memiliki urutan nukleotida. Primer sangat penting untuk replikasi DNA karena DNA polimerase tidak dapat mensintesis DNA baru tanpa sepotong DNA yang sudah ada sebelumnya. Saat mendesain primer untuk PCR, hal-hal berikut perlu dipertimbangkan:

• Primer harus mengandung nukleotida komplementer ke ujung sisi DNA yang ingin diamplifikasi.
• Primer harus memiliki suhu leleh antara 55 - 65 ⁰C
• Konten G dan C harus antara 50 hingga 60%.

Dua primer digunakan dalam PCR sebagai maju dan mundur untuk mereplikasi kedua untai sampel DNA. Primer biasanya digunakan untuk melakukan sekuensing PCR dan DNA.

Gambar 02: Primer annealing di PCR

Apa perbedaan antara Probe dan Primer?

Probe vs Primer
Probe adalah fragmen kecil DNA / RNA yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan target dalam sampel dengan hibridisasi molekuler.	Primer adalah bentangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik awal untuk replikasi DNA.
Fungsi
Ini mendeteksi adanya urutan tertentu dalam sampel DNA atau RNA.	Ini bertindak sebagai titik awal untuk sintesis DNA.
Panjangnya
Panjangnya bisa di kisaran 100 - 1000 pangkalan	Panjang umumnya sekitar 18 - 20 pangkalan
Mengikat dengan Urutan Pelengkap
Penyelidikan hibridisasi dengan basis pelengkap dari urutan target	Anil primer dengan basa pelengkap untaian DNA.
Pelabelan
Probe diberi label untuk kemudahan deteksi	Primer umumnya tidak diberi label
Gunakan di PCR
Probe tidak digunakan dalam PCR	Primer digunakan dalam PCR

Ringkasan - Probe vs Primer

Probe adalah sebuah fragmen kecil dari sekuens DNA atau RNA yang dapat digabungkan dengan nukleotida komplementer untuk mendeteksi sekuens target dalam sampel. Probe diberi label radioaktif, imunologis atau fluoresensi untuk melihat keberadaan urutan target. Primer adalah fragmen DNA atau RNA yang sangat kecil yang bertindak sebagai titik awal untuk in vitro Amplifikasi DNA. DNA polimerase mengidentifikasi 3 'OH primer kelompok dan memulai pembuatan untai baru yang melengkapi template. Probe dan primer bekerja dengan cara yang sama dengan hibridisasi dengan nukleotida komplementer. Dengan demikian, perbedaan utama antara probe dan primer adalah fungsi utamanya.

Referensi:
1. "Primer (biologi molekuler)." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 02 Feb. 2017. Web. 01 Maret 2017.
2. "Probe hibridisasi." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 30 Desember 2016. Web. 01 Maret 2017
3. "Primer (biologi molekuler)." Primer (biologi molekuler) - Topik ScienceDirect. N.p., n.d. Web. 01 Maret 2017

Gambar milik:
1. "IKAN untuk Identifikasi Bakteri Patogen" Oleh Pepetps Togopic Ivan Akira Magnus ManskeTimothy W. Ford - (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. “Primers RevComp Melted2” Oleh Richard Wheeler (Zephyris) - Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia