Blotting adalah teknik penting untuk mendeteksi urutan spesifik DNA, RNA, dan protein dari campurannya dalam biologi molekuler. Ini dilakukan dengan menggunakan membran yang disebut blot. Ada berbagai teknik blotting seperti blotting utara, selatan dan barat. Memilih membran yang tepat untuk proses blotting harus dilakukan dengan hati-hati untuk mencegah pengikatan yang tidak spesifik dan deteksi yang salah. Nitroselulosa, nilon, dan PVDF adalah membran yang biasa digunakan dalam teknik blotting. Mereka memiliki karakteristik berbeda. Perbedaan utama antara nitroselulosa dan membran nilon adalah bahwa membran nitroselulosa memiliki potensi imobilisasi protein yang tinggi sedangkan membran nilon memiliki potensi imobilisasi asam nukleat yang tinggi. Namun, kedua jenis membran ini sering digunakan dalam teknik blotting.
ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Membran Nitroselulosa
3. Apa itu Membran Nilon
4. Perbandingan Berdampingan -Nitroselulosa vs Membran Nilon
5. Ringkasan
Membran nitroselulosa adalah filter membran yang umum digunakan dalam teknik pembekuan asam nukleat dan protein. Ini memiliki potensi pengikatan protein yang tinggi. Oleh karena itu, membran nitroselulosa banyak digunakan dalam teknik western blotting. Membran nitroselulosa kompatibel dengan semua teknik hibridisasi dan menunjukkan kapasitas pengikatan superior tanpa gangguan. Selaput nitroselulosa secara alami bersifat hidrofilik. Mereka membuat interaksi hidrofilik dengan molekul dan secara efisien melumpuhkan mereka ke membran. Membran nitroselulosa komersial tersedia dalam dua ukuran pori: 0,45 dan 0,2 μm.
Gambar 01: Membran nitroselulosa yang digunakan dalam western blotting
Membran nilon adalah jenis lain dari membran komersial yang digunakan dalam teknik blotting. Alternatifnya digunakan dengan membran nitroselulosa untuk blotting selatan dan utara. Membran nilon ideal untuk pembekuan bagian selatan daripada nitroselulosa karena afinitasinya yang tinggi terhadap pengikatan dengan DNA. Karena beberapa fitur unik dari membran nilon, para peneliti umumnya menggunakan membran nilon untuk blotting selatan dan utara alih-alih lebih dari membran nitroselulosa. Membran nilon juga direkomendasikan untuk stripping dan reprobing, tidak seperti nitroselulosa.
Gambar 02: Membran nilon digunakan untuk blotting selatan
Membran Nitroselulosa vs Nilon | |
Selaput nitroselulosa rapuh. | Selaput nilon kurang rapuh. |
Penanganan | |
Mereka sulit ditangani. | Mereka mudah ditangani. |
Reprobing | |
Membran nitroselulosa yang tidak didukung sulit untuk dicetak ulang. | Reprobing mudah dilakukan dengan membran nilon. |
Kompatibilitas dengan Berbagai Kondisi Penyimpanan | |
Membran nitroselulosa memiliki kekuatan kurang untuk menahan berbagai kondisi penyimpanan. | Membran nilon merespons lebih kuat terhadap berbagai kondisi penyimpanan. |
Menggunakan | |
Prapengisian diperlukan. | Pra-pembasahan tidak diperlukan untuk membran nilon. |
Sifat Hidrofilik | |
Selaput nitroselulosa bersifat hidrofilik tetapi lebih sedikit hidrofilik dibandingkan membran nilon. | Mereka sangat hidrofilik. |
Potensi Imobilisasi | |
Membran nitroselulosa memiliki afinitas yang lebih rendah untuk asam nukleat. Tetapi memiliki afinitas tinggi terhadap protein. | Membran nilon memiliki potensi pengikatan yang tinggi dengan asam nukleat dibandingkan membran nitroselulosa. |
Nitroselulosa dan membran nilon adalah lembaran khusus yang digunakan dalam teknik blotting untuk mereproduksi pola pita pada gel. Mereka memungkinkan kemungkinan mendeteksi urutan tertentu atau protein dari campuran dengan melumpuhkan mereka pada membran. Setelah molekul diimobilisasi pada membran, ia dapat digunakan sebagai substrat untuk analisis hibridisasi dengan probe berlabel. Membran nitroselulosa biasanya digunakan untuk deteksi protein dalam teknik western blotting karena afinitas ikatannya yang tinggi dengan protein. Selaput nilon sering digunakan untuk blotting selatan dan utara. Ini adalah perbedaan antara membran nitroselulosa dan nilon.
Referensi:
1. Hayes, P. C., C. R. Wolf, dan J. D. Hayes. "Teknik blotting untuk studi DNA, RNA, dan protein." BMJ: British Medical Journal. Perpustakaan Kedokteran Nasional A.S., 14 Oktober 1989. Web. 07 April 2017
2. Mahmood, Tahrin, dan Ping-Chang Yang. "Western Blot: Teknik, Teori, dan Pemotretan Kesulitan." Jurnal Ilmu Kedokteran Amerika Utara. Medknow Publikasi & Media Pvt Ltd, September 2012. Web. 07 April 2017
Gambar milik:
1. "Western blot transfer" Oleh Bensaccount di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY 3.0) melalui Commons Wikimedia