Perbedaan Antara Elektroforesis Gel Horisontal dan Vertikal

Perbedaan Kunci - Elektroforesis Gel Horisontal vs Vertikal
 

Gel elektroforesis adalah teknik laboratorium yang digunakan dalam genetika untuk memisahkan campuran yang mengandung DNA, RNA, dan protein lain sesuai dengan muatan masing-masing dan ukuran molekul. DNA, RNA atau protein yang perlu dipisahkan dalam metode ini dijalankan melalui gel yang mengandung pori-pori kecil. Molekul digerakkan melalui gel oleh medan listrik. Molekul melewati pori-pori gel, dan kecepatan gerakan berbanding terbalik dengan panjang masing-masing. Oleh karena itu, molekul dengan ukuran molekul lebih rendah akan bergerak lebih cepat daripada molekul dengan berat molekul lebih tinggi. Medan listrik dihasilkan oleh perbedaan muatan pada dua ujung gel. Satu ujung berisi muatan positif, dan ujung lainnya berisi muatan negatif. Karena molekul DNA dan RNA bermuatan negatif, mereka akan tertarik ke arah ujung gel yang bermuatan positif. Elektroforesis gel dapat terdiri dari dua metode berbeda: elektroforesis gel horizontal dan elektroforesis gel vertikal. Dalam elektroforesis gel horisontal, gel hadir dalam orientasi horisontal dan direndam dalam buffer berjalan terus menerus yang hadir di dalam kotak gel itu sendiri. Dalam elektroforesis gel vertikal, sistem buffer diorientasikan secara vertikal dan tidak kontinu dengan dua ruang hadir di bagian atas dan bawah dengan katoda dan anoda, masing-masing. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel horizontal dan vertikal.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Elektroforesis Gel Horisontal
3. Apa itu Elektroforesis Gel Vertikal
4. Kesamaan Antara Elektroforesis Gel Horisontal dan Vertikal
5. Perbandingan Berdampingan - Elektroforesis Gel Horisontal vs Vertikal dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Elektroforesis Gel Horisontal?

Elektroforesis gel horizontal menggunakan teori dasar untuk pemisahan molekul DNA, RNA atau protein sesuai dengan ukuran dan muatan molekulnya masing-masing. Dalam teknik ini, gel hadir dalam orientasi horizontal dan direndam dalam buffer yang kontinu. Gel agarose digunakan untuk memisahkan kotak gel menjadi dua kompartemen. Salah satu ujung kotak gel berisi anoda sementara ujung lainnya berisi katoda. Ketika arus diterapkan, buffer yang digunakan dalam teknik ini memungkinkan pembuatan gradien muatan. Ketika muatan diterapkan, gel cenderung memanas. Buffer juga berfungsi sebagai pendingin, yang menjaga suhu pada tingkat optimal. Resirkulasi buffer berjalan mencegah pembentukan gradien pH. Sistem buffer terputus tidak dapat digunakan dalam elektroforesis gel horizontal karena dua kompartemen sistem gel terhubung dengan buffer berjalan. Acrylamide digunakan selama elektroforesis gel untuk memisahkan campuran protein.

Gambar 01: Elektroforesis Gel Horisontal

Dalam elektroforesis gel horizontal, akrilamida tidak dapat digunakan karena kotak gel terkena oksigen. Karena adanya oksigen, polimerisasi akrilamida terhambat, dan ini mengganggu pembentukan gel. Elektroforesis gel horizontal adalah metode mudah yang digunakan dalam pemisahan DNA dan RNA.

Apa itu Elektroforesis Gel Vertikal?

Fungsi teknik elektroforesis gel vertikal sesuai dengan teori utama elektroforesis gel, tetapi dianggap lebih kompleks daripada metode elektroforesis gel horisontal. Teknik ini menggunakan penyangga tidak terputus. Katoda terletak di bilik atas, dan anoda terletak di bilik bawah. Elektroda yang ada di setiap kompartemen menyediakan medan listrik yang diperlukan. Lapisan tipis gel dituangkan di antara dua pelat kaca yang terpasang. Oleh karena itu, bagian atas gel terendam dalam ruang atas, dan bagian bawah gel terendam dalam ruang di bagian bawah. Setelah arus diterapkan, sebagian kecil buffer bergerak ke ruang bawah dari ruang atas melalui gel. Arus yang digunakan dalam teknik ini adalah satuan menit.

Gambar 02: Elektroforesis Gel Vertikal

Dalam elektroforesis gel vertikal, buffer hanya mengalir melalui gel. Ini memungkinkan kontrol gradien tegangan yang akurat selama tahap pemisahan. Gel akrilamida dapat digunakan karena kompartemennya tidak terpapar oksigen atmosfer. Karena ukuran pori yang lebih kecil dari gel akrilamida, pemisahan yang tepat dapat dicapai dengan resolusi yang lebih tinggi.

Apa Persamaan Antara Elektroforesis Gel Horisontal dan Vertikal?

• Kedua sistem berfungsi sesuai dengan teori dasar elektroforesis gel.
• Anoda dan katoda digunakan untuk menyediakan medan listrik yang dibutuhkan di kedua sistem.

Apa Perbedaan Antara Elektroforesis Gel Horisontal dan Vertikal?

Elektroforesis Gel Horisontal vs Vertikal
Horizontal Gel Electrophoresis adalah teknik elektroforesis gel di mana gel hadir dalam orientasi horisontal.	Elektroforesis Gel Vertikal adalah teknik elektroforesis gel di mana gel diorientasikan secara vertikal.
Penyangga
Elektroforesis gel horizontal terdiri dari buffer kontinu.	Buffer yang berjalan tidak kontinu dalam elektroforesis gel vertikal.
Penggunaan Acrylamide
Acrylamide tidak dapat digunakan untuk elektroforesis gel horizontal karena kotak gel terkena oksigen atmosfer.	Karena gel tidak terpapar oksigen atmosferik akibat dua ruang terpisah, akrilamida dapat digunakan untuk elektroforesis gel vertikal.
Fungsi
Elektroforesis gel horisontal lebih sering digunakan untuk pemisahan campuran DNA dan RNA tetapi tidak untuk protein.	Elektroforesis gel vertikal digunakan untuk memisahkan campuran protein.

Ringkasan - Elektroforesis Gel Horisontal vs Vertikal

Gel elektroforesis adalah teknik laboratorium yang banyak digunakan dalam pemisahan campuran yang mengandung molekul DNA, RNA, dan protein. Ada dua metode elektroforesis gel: elektroforesis gel horizontal dan vertikal. Dalam elektroforesis gel horisontal, buffer berjalan adalah kontinu sedangkan dalam elektroforesis gel vertikal, itu terputus-putus. Ini adalah perbedaan antara elektroforesis gel horizontal dan vertikal. Kedua sistem berfungsi sesuai dengan prinsip umum elektroforesis gel.

Unduh Versi PDF dari Elektroforesis Gel Horisontal vs Vertikal

Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara Elektroforesis Gel Horisontal dan Vertikal.

Referensi:

1. Warren, Chad M., et al. "Elektroforesis gel agarosa vertikal dan electroblotting protein dengan berat molekul tinggi." Elektroforesis, vol. 24, tidak. 11, 2003, hlm. 1695-1702., Doi: 10.1002 / elps.200305392.
2. "Sistem Gel Horisontal dan Vertikal - Sistem Gel Horisontal." Diagnostik Nasional, Tersedia di sini. Diakses 28 Agustus 2017.

Gambar milik:

1. "Peralatan elektroforesis gel" Oleh Jeffrey M. Vinocur - Pekerjaan sendiri (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia
2. "Elektroforesis gel poliakrilamid dari Protein" Oleh Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier dari Bruxelles, Belgia - Protein dalam elektroforesis gel 1D (CC BY-SA 2.0) melalui Commons Wikimedia