Perbedaan Antara Exome dan Transkriptome

Perbedaan Utama - Exome vs Transcriptome
 

Sebuah gen berisi wilayah pengkodean dan non-pengkodean di dalamnya. Urutan kode dikenal sebagai ekson, dan urutan non-kode dikenal sebagai intron. Urutan nukleotida ekson gen mewakili kode genetik gen untuk mensintesis protein spesifik. Oleh karena itu, ekson tetap dalam molekul mRNA. Daerah ekson total genom dikenal sebagai eksom, dan merupakan bagian penting dari genom. Kode genetik gen diubah menjadi kode genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk produksi protein. Seluruh molekul mRNA yang ditranskripsi dalam sel atau populasi sel pada suatu waktu dikenal sebagai transkriptom. Perbedaan utama antara exome dan transkriptome adalah itu exome mewakili urutan wilayah ekson genom sementara transkriptome mewakili mRNA total sel atau jaringan pada waktu tertentu.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Exome
3. Apa itu Transkriptome
4. Perbandingan Berdampingan - Exome vs Transcriptome
5. Ringkasan

Apa itu Exome??

Gen terdiri dari ekson, intron, dan sekuens pengatur. Ekson adalah daerah gen yang ditranskripsi menjadi urutan mRNA selama transkripsi. Intron dan daerah non-coding lainnya dihapus selama transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kode genetik gen yang mensintesis protein spesifik yang dikodekannya. Hanya ekson yang tersisa dalam mRNA protein. Pengumpulan ekson dalam genom dikenal sebagai eksome dari suatu organisme. Ini merupakan bagian dari genom yang diekspresikan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ini adalah bagian pengkode protein dari genom manusia.

Gambar 01: Exome

Apa itu Transkriptome?

Transkriptom adalah kumpulan semua transkrip protein dan non-coding (RNA) dalam jaringan yang diberikan. Transkriptome mewakili kumpulan total molekul mRNA yang diekspresikan oleh gen dalam sel atau jaringan. Transkripom sel dapat bervariasi dengan transkriptom tipe sel lain. Transkriptom juga dinamis - ia berubah seiring waktu sebagai respons terhadap rangsangan internal dan eksternal. Bahkan dalam jaringan yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkriptom dapat berubah setelah beberapa menit.

Transkriptom berbeda dari eksom suatu organisme. Transkriptome hanya mencakup urutan exome yang diungkapkan. Meskipun eksome sel tetap sama, transkriptom berbeda di antara sel karena ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau jaringan. Hanya gen esensial yang diekspresikan dalam sel dan jaringan berbeda. Ekspresi gen adalah proses spesifik jenis jaringan atau sel. Ini diatur oleh berbagai faktor termasuk faktor lingkungan. Oleh karena itu, transkriptome dapat bervariasi dengan kondisi lingkungan eksternal.

Transkriptome digunakan sebagai prekursor untuk studi proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Modifikasi translasi dapat menyebabkan perubahan protein. Namun, transkriptom memberikan informasi dasar yang penting untuk studi proteomik.

Gambar 02: Transkriptome sel induk embrionik

Apa perbedaan antara Exome dan Transcriptome?

Exome vs Transcriptome
Exome adalah kumpulan daerah pengkode protein dari gen.	Transkriptome adalah kumpulan dari semua RNA yang ditranskripsi termasuk mRNA.
Sampel
Exome dipelajari menggunakan sampel DNA.	Transkriptome dipelajari menggunakan sampel RNA.
Metode Studi
Urutan exome seluruh adalah metode belajar exome.	Sequencing RNA adalah metode mempelajari transkriptome.

Ringkasan - Exome vs Transcriptome

Ekson adalah urutan pengkodean gen dan menentukan urutan mRNA protein. Kumpulan urutan pengkodean (ekson) ini dikenal sebagai eksome dari suatu organisme. Gen ditranskripsi menjadi molekul mRNA sebelum membuat protein. Molekul mRNA total sel atau jaringan pada waktu tertentu dikenal sebagai transkriptom. Transkriptome mewakili gen yang secara aktif diekspresikan ke mRNA pada waktu tertentu. Transkriptome adalah sel dan jaringan spesifik dan mempengaruhi kondisi lingkungan. Inilah perbedaan antara exome dan transkriptome.

Referensi:
1.Sarah et al, "Pengambilan Target dan Urutan Paralel Dua Belas Manusia yang Masif secara paralel." Alam. Perpustakaan Kedokteran Nasional A.S., 10 September 2009. Web. 01 April 2017
2.Mutz et al. "Analisis transkriptom menggunakan sequencing generasi berikutnya." Elsevier: Pencari Lokasi Artikel. N.p., September 2012. Web. 01 April 2017

Gambar milik:
1. "Transkriptome sel pluripoten" Oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkriptome pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Riset Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Gambar 2 Transkriptom sel pluripoten.Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkriptom pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Riset Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia