Perbedaan Antara YAC dan M13 Phage Vector

Perbedaan Kunci - YAC vs M13 Phage Vector
 

Kloning DNA adalah proses penting yang memungkinkan penyebaran fragmen DNA penting dari organisme. Dibutuhkan penggabungan DNA spesifik dengan vektor DNA untuk membuat DNA rekombinan yang berubah menjadi organisme inang. Vektor adalah molekul DNA yang berperilaku sebagai kendaraan untuk membawa materi genetik asing ke dalam sel atau organisme lain. Itu harus mampu mereplikasi di dalam organisme inang dan menghasilkan beberapa salinan DNA rekombinan. Ada berbagai jenis vektor yang digunakan dalam kloning DNA. Yeast artificial chromosome (YAC) dan vektor fag M13 adalah dua jenis di antaranya. Perbedaan utama antara vektor fag YAC dan M13 adalah itu YAC adalah kromosom buatan yang mereplikasi dalam sel ragi sementara Vektor fag M13 adalah DNA melingkar beruntai tunggal dari bakteriofag M13 yang bereplikasi di E Coli sel.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu YAC
3. Apa itu M13 Phage Vector
4. Perbandingan Berdampingan - YAC vs M13 Phage Vector
5. Ringkasan

Apa itu vektor YAC?

YAC adalah kromosom buatan yang memiliki kemampuan untuk membawa sebagian besar DNA asing dan mereplikasi dalam sel-sel ragi. Ini memiliki urutan sentromer, telomer dan replikasi otonom yang penting untuk replikasi dan stabilitas. YAC juga harus memiliki marker atau marker selektif dan situs restriksi untuk menjadikannya vektor kloning yang efektif. Urutan besar mulai dari 1000 kb hingga 2000 kb dapat dimasukkan ke YAC dan ditransfer ke ragi.

Gambar 01: YAC Vector

Apa itu M13 Phage Vector?

Bacteriophage M13 adalah virus yang menginfeksi dan bereplikasi di E Coli. Genom bakteriofag M13 berukuran kecil, sekitar 6,7 kb. Ini adalah DNA akal beruntai tunggal, bundar dan positif. Virus ini secara khusus menginfeksi E Coli bakteri melalui F pilus. Setelah memasuki ssDNA ke dalam bakteri, ia mensintesis untai komplementer dan menjadi dsDNA atau bentuk replikasi (RF) dari M13. RF dapat berperilaku seperti plasmid dalam organisme inang. DsDNA mereplikasi di dalam E Coli dan menghasilkan ssDNA yang mengandung fag baru. Fag baru ini terus menerus dirilis dari E Coli tanpa membunuh sel inang. Namun, infeksi memperlambat pertumbuhan E Coli. dsDNA dapat diekstraksi dari sel bakteri dan digunakan sebagai vektor dalam kloning DNA. Mereka dikenal sebagai vektor fag M13. Mereka dapat dengan mudah dimanipulasi dan digunakan mirip dengan vektor plasmid.

Kemampuan bawaan dari infeksi fag M13 ini berfungsi sebagai kualifikasi yang baik untuk digunakan sebagai vektor dalam kloning gen. Ketika mengembangkan M13 menjadi vektor, beberapa elemen harus dimasukkan ke dalam genomnya. Mereka adalah, gen untuk protein penekan lac (lac I), daerah proksimal operator dari lac Z gen, promotor lac dan situs kloning ganda (polylinker). Ketika dsDNA dari M13 digunakan sebagai vektor, ia dapat diperlakukan sebagai vektor plasmid. Namun, penggunaan ssDNA M13 memiliki kelebihan dalam sekuensing DNA dan mutagenesis terarah-situs.

Karena vektor fag M13 mengandung beberapa situs kloning di lacZ wilayah, rekombinasi vektor dapat dengan mudah diidentifikasi oleh skrining koloni biru / putih pada piring agar yang mengandung IPTG dan X-Gal. Plak biru yang diproduksi di atas lempeng tidak mengandung fag rekombinasi. Oleh karena itu, fag dengan sisipan dapat dipilih untuk tujuan kloning.

Gambar 02: Bacteriophage M13

Apa perbedaan antara YAC dan M13 Phage Vector?

YAC vs M13 Phage Vector

YAC adalah kromosom rekayasa genetika yang memiliki kemampuan untuk membawa sebagian besar DNA asing dan mereplikasi dalam sel-sel ragi. Vektor fag M13 adalah vektor virus yang dikembangkan oleh bakteriofag M13 yang digunakan untuk memasukkan DNA asing ke dalam E Coli.
Tujuan
YAC dirancang untuk mengkloning fragmen besar DNA genom ke dalam ragi. Vektor fag M13 digunakan untuk memasukkan DNA asing ke dalam E Coli.
Masukkan Panjang
YAC dapat mengandung sisipan genomik berukuran megabase (1000 kb - 2000 kb). Ukuran sisipan sekitar 1.500 bps.
Konstruksi
DNA YAC sulit untuk dimurnikan secara utuh dan membutuhkan konsentrasi tinggi untuk menghasilkan sistem vektor YAC. Ini terjadi melalui rantai elektron fotosintesis siklik.
Stabilitas
YAC tidak stabil. Fag M13 dapat dengan mudah diekstraksi.
Ukuran
Enzim adalah molekul yang lebih besar. Fag M13 lebih stabil dari YAC.

Ringkasan - YAC vs M13 Phage Vector

YAC adalah sistem vektor yang dibangun secara artifisial menggunakan wilayah spesifik kromosom ragi untuk memasukkan segmen besar bahan genetik ke sel-sel ragi. Vektor fag M13 adalah sistem vektor yang berasal dari bacteriophage M 13 yang digunakan E coli sebagai organisme inang. Ini adalah perbedaan utama antara YAC dan M13 Phage Vector. Keduanya sama-sama berguna dalam teknologi DNA rekombinan dan kloning gen.

Referensi:
1. "Vektor." Genetika-catatan - Vektor. N.p., n.d. Web. 16 Mei 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Kromosom buatan ragi." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 21 April 2017. Web. 16 Mei 2017. .

Gambar milik:
1. "M13B" Oleh J3D3 - Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia