Perbedaan Antara VNTR dan STR

Perbedaan Utama - VNTR vs STR
 

Studi DNA memiliki kegunaan yang sangat besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan memetakan genom organisme. Beberapa teknik yang terkait dengan analisis DNA digunakan untuk identifikasi gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenal sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekuler untuk mengidentifikasi variasi genetik antara individu dan spesies. Variable number tandem repeat (VNTR) dan short tandem repeat (STR) adalah dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme di antara individu. Kedua jenis tersebut adalah DNA berulang nonkoding yang merupakan pengulangan tandem. Mereka diatur dalam mode head to tail dalam kromosom. VNTR adalah bagian dari genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR adalah bagian lain dari DNA dalam genom yang disusun sebagai unit berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas nukleotida dalam ratusan kali. Perbedaan utama antara VNTR dan STR adalah jumlah nukleotida dalam urutan berulang. Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida sedangkan unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara luas dalam studi forensik.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu VNTR 
3. Apa itu STR
4. Kesamaan Antara VNTR dan STR
5. Perbandingan Berdampingan - VNTR vs STR dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu VNTR?

Pengulangan tandem adalah urutan pendek DNA yang diulang dalam mode head to tail di lokus kromosom tertentu. Tidak ada urutan atau nukleotida lain dalam pengulangan tandem. Ada beberapa jenis pengulangan tandem dalam genom. VNTR adalah jenis pengulangan tandem di antara mereka yang memiliki unit berulang yang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. VNTR adalah jenis satelit mini. Pengulangan tandem ini dapat ditemukan di banyak kromosom. Mereka diselingi dalam genom manusia dan terletak terutama di daerah subtelomer kromosom.

 VNTRs menunjukkan tandem polimorfisme berulang di antara individu. Panjang VNTR di lokasi tertentu kromosom sangat bervariasi di antara individu-individu karena variasi dalam jumlah unit berulang yang diatur dalam bagian DNA itu. Oleh karena itu, VNTR dapat digunakan sebagai alat yang kuat dalam identifikasi individu dan analisis VNTR digunakan di banyak bidang termasuk genetika, penelitian biologi, forensik dan pencetakan jari DNA. VNTR adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur pencangkokan transplantasi sumsum tulang. VNTR juga merupakan penanda polimorfik pertama yang digunakan dalam profiling DNA dalam forensik.

Gambar 01: Variasi VNTR dalam enam individu

Analisis VNTR dilakukan melalui pembatasan polimorfisme panjang fragmen diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh karena itu, dibutuhkan sampel DNA yang besar secara komparatif. Interpretasi profil VNTR juga bermasalah. Karena keterbatasan ini, penggunaan VNTR dalam genetika forensik telah terbatas dan digantikan oleh analisis STR.

Apa itu STR?

STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit berulang nukleotida yang diorganisir secara tandem. STR mirip dengan VNTR. Tapi itu bervariasi dari VNTR dari jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan jumlah pengulangan. STR adalah jenis mikrosatelit.

Analisis STR terlibat dalam mengukur jumlah pasti unit berulang. STR sangat bervariasi di antara individu, mirip dengan VNT. Profil STR berbeda dari orang ke orang. Oleh karena itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekuler untuk membandingkan lokus spesifik pada DNA dari dua sampel atau lebih. Oleh karena itu STR dianggap sebagai penanda genetik yang kuat dalam biologi molekuler. Ini menyediakan alat yang sangat baik untuk mengidentifikasi individu karena tingkat polimorfisme yang tinggi dan panjang yang relatif pendek.

Saat ini, STR adalah alat polimorfisme genetik dianalisis yang paling umum digunakan dalam genetika forensik. Kebanyakan kerja forensik melibatkan analisis polimorfik STR. Lokus STR tersebar di seluruh genom. Ada ribuan STR yang terletak di kromosom yang dapat digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang restriksi seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim restriksi. Probe spesifik digunakan untuk melampirkan daerah yang diinginkan pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.

Gambar 02: Variasi STR antara sampel

Apa Persamaan Antara VNTR dan STR?

• VNTR dan STR adalah DNA bukan kode.
• Keduanya adalah pengulangan tandem.
• Keduanya menunjukkan polimorfisme di antara individu karena perbedaan panjang bagian DNA.
• Keduanya digunakan sebagai penanda genetik yang kuat dalam pencetakan jari DNA dan dalam studi forensik.

Apa Perbedaan Antara VNTR dan STR?

VNTR vs STR
VNTR adalah DNA berulang tanpa kode yang memiliki urutan nukleotida pendek yang diulang secara tandem.	STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit berulang nukleotida yang diorganisir secara tandem.
Ukuran
VNTR lebih besar dari STR.	STR lebih kecil dari VNTR.
Jumlah Nukleotida dalam Urutan Berulang
Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida.	Unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida.

Ringkasan - VNTR vs STR

VNTR dan STR adalah dua penanda genetik kuat yang digunakan dalam biologi molekuler, terutama di bidang genetika forensik. VNTR adalah jenis satelit mini dan STR adalah satelit mikro. VNTR dan STR adalah noncoding, DNA yang sangat berulang. Mereka adalah pengulangan tandem. Struktur umum VNTR dan STR adalah sama. Namun, jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan panjangnya berbeda. VNTR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. STR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. Inilah perbedaan antara VNTR dan STR.

Unduh versi PDF VNTR vs STR

Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara VNTR dan STR.

Referensi:

1. "Ilmu Genetika Forensik." CRG - Dewan Genetika yang Bertanggung Jawab. N.p., n.d. Web. Tersedia disini. 10 Juli 2017.
2. "Analisis STR." Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 Maret 2017. Web. Tersedia disini. 10 Juli 2017.

Gambar milik:

1. "D1S80Demo" Oleh PaleWhaleGail di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia