Perbedaan Antara DNA Hulu dan Hilir

Perbedaan Utama - DNA Hulu vs Hilir
 

Penting untuk memiliki pengetahuan umum tentang komposisi dan struktur DNA untuk memahami perbedaan antara DNA hulu dan hilir. DNA tersusun atas rantai polinukleotida. Nukleotida adalah blok bangunan yang menciptakan rantai polinukleotida dan masing-masing nukleotida dibuat dari tiga komponen: gula lima karbon, basa nitrogen, dan gugus fosfat. Gugus fosfat dan gugus OH masing-masing terikat pada karbon posisi 5 'dan karbon posisi 3' dalam nukleotida. Nukleotida bergabung bersama oleh ikatan fosfodiester yang terbentuk antara 5 'gugus fosfat satu nukleotida dan 3' OH kelompok nukleotida yang berdekatan. Jika rantai polinukleotida memiliki gugus fosfat 5 'bebas, rantai tersebut ditetapkan sebagai ujung 5'; jika memiliki kelompok OH 3 'gratis, ia ditugaskan sebagai ujung 3'. Oleh karena itu, untaian DNA biasanya memiliki ujung 5 'dan 3' sesuai dengan posisi ujung rantai polinukleotida. DNA juga ada sebagai bentuk untai ganda. Dua untai saling berlawanan satu sama lain. Oleh karena itu, DNA memiliki dua untaian yang berjalan ke arah 5 'ke 3' dan 3 'ke 5'. DNA hulu dan hilir disebut dengan referensi untuk transkripsi dan sintesis untai mRNA 5 'sampai 3'. Jika DNA dianggap menuju 5 ujung untai pengkode dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hulu. Jika DNA dianggap pada ujung 3 'dari untai kode dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir. Inilah perbedaan utama antara DNA hulu dan hilir.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu DNA Hulu
3. Apa itu DNA Hilir
4. Perbandingan Berdampingan - DNA Hulu vs Hilir
5. Ringkasan

Apa itu DNA Hulu?

Gen adalah unit hereditas struktural dan fungsional yang terletak pada DNA suatu organisme. Itu disimpan dengan instruksi untuk membangun protein. Gen tersebut memiliki wilayah spesifik dari molekul DNA. Bila diperlukan, ia mentranskripsi dan menerjemahkan menjadi protein melalui sintesis untai mRNA. Biasanya untaian kode gen berjalan dari arah 5 'ke 3'. Ketika ditranskrip, ia menghasilkan untai mRNA ke arah yang sama 5 'sampai 3'. Selama transkripsi, untai antisense 3 'hingga 5' disajikan sebagai untai templat dan memulai sintesis mRNA. Ada situs inisiasi transkripsi dalam gen. Dengan mengacu pada situs inisiasi transkripsi, wilayah DNA menuju ujung 5 'dari untaian kode dikenal sebagai DNA hulu. Seorang promotor gen biasanya terletak di daerah hulu DNA. Dalam gen eukariotik, ada kotak TATA, elemen proksimal promotor, dan peningkat di daerah hulu ke gen. Wilayah hulu gen disebut dengan angka negatif. DNA hulu suatu gen sangat penting untuk transkripsi.

Apa itu DNA Hilir?

Situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai +1 gen. Wilayah DNA dari titik +1 ke ujung 3 'dari untai pengkode dikenal sebagai DNA hilir. Dengan kata lain, hilir gen berasal dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 5 'dari untai cetakan. Oleh karena itu, DNA hilir suatu daerah gen mencakup unit transkripsional dan sekuens lain seperti sekuens terminator. Promotor dapat memengaruhi urutan gen hilir. Bagian hilir gen disebut dengan angka positif. DNA hilir suatu gen adalah wilayah aktual yang menghasilkan produk protein.

Gambar 01: DNA Hulu dan Hilir

Apa perbedaan antara DNA Hulu dan Hilir?

DNA Hulu vs Hilir
Wilayah DNA menuju ujung 5 'dari urutan pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hulu.	Wilayah DNA menuju ujung 3 'dari untai kode dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir.
Elemen
Promotor dan enhancer terletak di DNA hulu	Unit transkripsi dan urutan terminator terletak di DNA hilir.
Penomoran
Nukleotida di daerah hulu disebut dengan angka negatif	Nukleotida disebut dengan angka positif.
Fungsi
Wilayah ini mengandung elemen yang diperlukan untuk mengatur dan memulai transkripsi	Wilayah ini berisi instruksi untuk menghasilkan protein dan menghentikan transkripsi

Ringkasan - DNA Hulu vs Hilir

Mudah untuk mengidentifikasi hulu dan hilir untai RNA. Berkenaan dengan situs referensi, daerah menuju ujung 5 'dari untai RNA dikenal sebagai RNA hulu sedangkan daerah menuju ujung 3' dikenal sebagai RNA hilir. Namun, dalam DNA, ada dua untai yang berjalan di kedua arah 5 'ke 3' dan 3 'ke 5'. Oleh karena itu, perbedaan antara DNA hulu dan hilir menjadi rumit. Oleh karena itu, ia dibedakan dengan referensi pada transkripsi gen. Dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 5 untai indra, wilayah DNA dikenal sebagai DNA hulu sedangkan dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 3 'untai indra dikenal sebagai DNA hilir. Inilah perbedaan antara hulu dan hilir DNA.

Referensi:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi, dan Jonatha M. Gott. "Peran berbeda untuk urutan hulu dan hilir dari situs Physarumediting." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, September 2009. Web. 18 Maret 2017

Gambar milik:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro, dan Luísa Romão. "Regulasi Ekspresi Gen oleh Bingkai Membaca Terbuka Hulu dan Penyakit Manusia." PLOS Genetika. Perpustakaan Umum Ilmu Pengetahuan, n.d. Web. 18 Maret 2017.