Perbedaan Antara Proteomik Target dan Untargeted

Perbedaan utama antara proteomik target dan tidak bertarget adalah bahwa Proteomik yang ditargetkan bertujuan untuk mengukur kelimpahan protein tertentu sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu.

Proteomik adalah studi skala besar tentang protein, struktur, dan fungsinya. Ini mempelajari seluruh pelengkap protein dalam sel, jaringan atau organisme dalam kondisi tertentu. Ada dua jenis proteomik sebagai proteomik bertarget dan proteomik tak bertarget.

KANDUNGAN

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa yang Ditargetkan Proteomics
3. Apa itu Proteomik yang Tidak Dicari
4. Kesamaan Antara Proteomik Target dan Untargeted
5. Perbandingan Berdampingan - Proteomik Bertarget vs Tidak Ditargetkan dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Proteomik Bertarget??

Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein spesifik atau peptida dalam campuran kompleks protein untuk dianalisis. Kemudian ia menganalisis keberadaan dan kuantitas protein spesifik yang dipilih sebelumnya. Metode ini hanya mungkin untuk satu sampel atau beberapa sampel. Metode ini cocok bahkan untuk kelompok protein tertentu. Ini menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Selain itu, spektrometri massa ditambah dengan proteomik yang ditargetkan menghasilkan pengukuran yang lebih andal dan akurat. Metode ini menggunakan spektrometer massa triple quadrupole (QQQ) untuk analisisnya.

Gambar 01: Proteomik

Proteomik bertarget adalah metode yang cocok jika Anda ingin memverifikasi apakah target knockdown benar-benar dirobohkan atau ketika Anda ingin menghitung protein / peptida tertentu dalam serum darah, cairan otak atau lisat sel dll. Anda juga dapat menggunakannya jika Anda ingin untuk memeriksa apakah suatu protein tertentu diekspresikan secara berbeda di seluruh sampel atau selama percobaan kursus waktu.

Apa itu Proteomik Tidak Dicari?

Proteomik yang tidak tercatat, seperti namanya, tidak menargetkan protein atau peptida spesifik untuk analisisnya. Proteomik penemuan adalah nama lain untuk proteomik Untargeted. Bahkan, ini adalah analisis yang lebih 'global'. Secara umum, melakukan proteomik tanpa target adalah untuk menjawab pertanyaan "protein atau protein apa yang ada dalam sampel ini atau beberapa sampel?". Metode ini tidak sensitif sebagai proteomik yang ditargetkan. Tetapi dapat mengidentifikasi dan mengukur banyak protein termasuk protein baru. Proteomik yang tidak tercatat dapat menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.

Apa Persamaan Antara Proteomik Target dan Untargeted?

• Proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan mengukur protein dalam sampel.
• Mereka penting dalam analisis proteome.
• Metode ini menggunakan spektrometri massa.

Apa Perbedaan Antara Proteomik Target dan Untargeted?

Pertama, proteomik yang ditargetkan adalah penentuan keberadaan dan jumlah protein atau peptida tertentu dalam campuran kompleks protein. Sebaliknya, proteomik yang tidak ditargetkan adalah studi kuantitatif dan kualitatif protein yang ada dalam sampel atau sampel tanpa menargetkan protein tertentu. Proteomik target dilakukan dengan protein yang dipilih atau ditargetkan sementara proteomik yang tidak ditargetkan dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Selain itu, proteomik yang ditargetkan lebih sensitif daripada proteomik yang tidak ditargetkan.

Ringkasan - Proteomik Bertarget vs. Tidak Ditargetkan

Singkatnya, proteomik yang ditargetkan dan tidak ditargetkan adalah dua jenis studi protein. Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein tertentu sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu. Ini adalah perbedaan antara proteomik yang ditargetkan dan yang tidak ditargetkan.

Referensi:

1. “Proteomik Bertarget.” UC Davis Proteomics Core, Tersedia di sini.
2. "Proteomik / Pengantar Proteomik." Teori / Mode Musik - Wikibooks, Buku Terbuka untuk Dunia Terbuka, Tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Proteomics" Oleh Xxl7441 di English Wikibooks - Ditransfer dari en.wikibooks ke Commons (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia