Itu perbedaan utama antara Rho dependen dan penghentian independen Rho adalah bahwa dalam Pemutusan ketergantungan Rho, faktor Rho mengikat dengan transkrip dan mengakhiri transkripsi dengan memutus ikatan hidrogen antara templat dan transkrip, sementara terminasi Rho mengakhiri transkripsi dengan memproduksi struktur loop jepit rambut dan kemudian wilayah kaya U dalam transkrip.
Transkripsi adalah salah satu dari dua tahap ekspresi gen. Ini adalah proses yang menghasilkan urutan mRNA dari informasi genetik yang tersembunyi dalam urutan DNA gen. Transkripsi dilakukan melalui tiga langkah: inisiasi, perpanjangan dan penghentian. Enzim RNA polimerase berikatan dengan urutan promotor gen dan mulai mengkatalisis sintesis untai RNA. Sampai urutan terminator ditemukan, RNA polimerase menambahkan nukleotida dan membangun untai RNA. Dalam prokariota, penghentian terjadi melalui dua strategi penghentian utama: penghentian ketergantungan Rho dan penghentian independen Rho. Faktor Rho adalah protein yang memiliki aktivitas helikase.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Rho Dependent Termination
3. Apa itu Pemutusan Independen Rho
4. Kesamaan Antara Rho Dependent dan Rho Independent Termination
5. Perbandingan Berdampingan - Rho Dependent vs Rho Independent Termination dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Pengakhiran ketergantungan Rho adalah salah satu dari dua jenis strategi pemutusan transkripsi yang terjadi pada prokariota. Faktor Rho adalah protein yang memiliki aktivitas helikase.
Gambar 01: Rho Dependent Termination
Protein Rho berikatan dengan transkrip RNA dan bergerak di sepanjang RNA polimerase dalam arah 5'-3 ', mendorong disosiasi ikatan hidrogen antara templat DNA dan transkrip RNA. Ketika faktor Rho mencapai gelembung transkripsi, ia menarik hibrid DNA / RNA terpisah dan melepaskan transkrip dari gelembung transkripsi. Ketika ini terjadi, itu mengakhiri transkripsi.
Pemutusan independen Rho adalah strategi kedua yang mengakhiri transkripsi prokariotik. Biasanya, daerah terminator memiliki urutan berulang terbalik. Segera setelah urutan berulang terbalik, ada wilayah kaya Adenine (AAAA). Ketika RNA polimerase bergerak maju, itu menghasilkan urutan mRNA. Karena kedua daerah tersebut saling melengkapi dalam daerah urutan pengulangan terbalik, maka ia membentuk struktur loop rambut karena ikatan hidrogen. Wilayah selanjutnya adalah wilayah kaya U. Struktur jepit rambut menghentikan aktivitas RNA polimerase.
Gambar 02: Rho Independent Termination
Selain itu, di wilayah kaya U, ada interaksi yang lemah antara basis U transkrip dan basis A template. Ikatan Adenine-Urasil yang lemah ini merusak kestabilan templat DNA dan transkrip RNA dan memisahkan satu sama lain. Pada akhirnya, transkrip membebaskan dari situs transkripsi.
Pemutusan ketergantungan Rho dimediasi oleh protein Rho sementara penghentian Rho independen terjadi melalui pembentukan struktur loop jepit rambut. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara Rho dependen dan penghentian independen Rho. Lebih lanjut, protein Rho menggunakan energi ATP sementara penghentian Rho independen tidak melibatkan protein Rho dan tidak menggunakan energi ATP. Oleh karena itu, ini juga merupakan perbedaan yang signifikan antara penghentian Rho dependen dan independen Rho.
Infografis di bawah ini menunjukkan lebih banyak perbandingan terkait dengan perbedaan antara penghentian Rho dependen dan independen Rho.
Pemberhentian Rho dependen dan Rho independent adalah dua mekanisme terminasi transkripsi utama yang terjadi pada prokariota. Protein Rho bertanggung jawab atas terminasi transkripsi pada terminasi yang bergantung pada Rho. Sebaliknya, pemutusan independen Rho terjadi melalui pembentukan struktur loop jepit rambut. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara Rho dependen dan penghentian independen Rho.
1. "Tahapan Transkripsi." Khan Academy, Tersedia di sini.
2. "Pengakhiran Intrinsik." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8 Februari 2019, Tersedia di sini.
1. "Terminator yang bergantung pada Rho" Oleh Oalnafo1 - Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. "Terminator Rho-independent" Oleh Ppgardne di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia