DNA polimerase adalah enzim yang banyak digunakan dalam teknik biologi molekuler dan juga ada secara alami di semua organisme yang menjalani replikasi DNA. Mereka adalah enzim polimerisasi kunci yang terlibat selama replikasi. DNA polimerase mampu menambahkan nukleotida ke ujung 3 'bebas dari untai DNA sehingga menyebabkan perpanjangan untai baru. Saat ini, karena perkembangan biologi molekuler dalam diagnostik penyakit dan aplikasi industri, penting untuk memproduksi polimerase yang memiliki berbagai sifat menguntungkan. Ini meningkatkan akurasi metode dan membuatnya menjadi teknik yang lebih cepat. Phusion dan Taq polimerase adalah dua enzim polimerase termostabil yang diproduksi secara komersial yang digunakan dalam aplikasi molekul khusus. Phusion adalah DNA polimerase yang diisolasi dari Pyrococcus furiosus dan terutama digunakan dalam percobaan kloning untuk meningkatkan kesetiaan. Taq DNA Polymerase adalah DNA polimerase standar yang digunakan dalam Polymerase Chain Reaction (PCR), dan diisolasi dari bakteri termostabil; Thermus aquaticus. Itu perbedaan utama antara kedua enzim tersebut adalah sumber mikroorganisme. Phusion diisolasi dari ekstrofil, Pyrococcus furiosus sedangkan, Taq polimerase diisolasi dari termofil, Thermus aquaticus.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Phusion?
3. Apa itu Taq Polymerase
4. Kesamaan Antara Phusion dan Taq Polymerase
5. Perbandingan Berdampingan - Phusion vs Taq Polymerase dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Phusion DNA polimerase adalah polimerase baru yang diproduksi dengan mengisolasi enzim dari Pyrococcus furiosus, yang merupakan Archaea ekstrofilik. Mikroba ini berada dalam kondisi suhu yang sangat tinggi, sehingga menjadikan polimerase sebagai polimerase yang sangat stabil terhadap panas. Phusion polimerase digunakan untuk memperoleh kesetiaan ekstrem terhadap polimerase termostabil konvensional; Taq polimerase. Phusion polimerase mampu memperkuat template panjang hingga 7,5 kb DNA genom. Kapasitas polimerisasi optimal Phusion polimerase adalah pada 720 C. Phusion juga digunakan dalam kloning produk untuk sekuensing, analisis ekspresi, dan analisis mutasi.
Phusion DNA polimerase memiliki aktivitas exonuclease 3 '- 5'. Ini memungkinkan proofreading dari untai yang baru disintesis setelah sintesis. Oleh karena itu, ketidakcocokan nukleotida mudah diperbaiki. Dengan demikian, ia memiliki tingkat kesalahan yang lebih rendah. Keuntungan keseluruhan dari Phusion polimerase adalah;
Gambar 01: Phusion
Kerugian utama dari Phusion polimerase adalah bahwa ia dihambat dengan adanya deoxyuridine triphosphate (dUTP). Ketika dUTP terakumulasi dalam campuran reaksi, itu dapat menghambat aksi Phusion polimerase. Ini dicegah dengan memperlakukan campuran reaksi dengan dUTPase sebelum menambahkan enzim. Saat ini, varian tahan dUTP dari Phusion polimerase yang dikenal sebagai Pfu Turbo digunakan sebagai pengganti Phusion polimerase sebagai obat untuk masalah ini..
Taq DNA polimerase Penemuan telah merevolusi bidang biologi molekuler. Ini memecahkan masalah utama dalam amplifikasi DNA. Taq DNA polimerase adalah enzim polimer stabil panas yang diekstraksi dan diisolasi dari bakteri termofilik, Thermus aquaticus. Penemuan enzim ini mengarah pada pengembangan PCR. Enzim ini telah memungkinkan penggunaan reaksi berantai polimerase dalam amplifikasi DNA alih-alih teknik kloning yang melelahkan konvensional. PCR sekarang digunakan dalam bidang diagnosa molekuler, pertanian dan industri dengan banyak variasi baru ditambahkan ke teknik.
Gambar 02: Taq Polymerase
Taq DNA polimerase berfungsi pada kisaran suhu optimal antara 720C - 800C. Taq DNA polimerase membutuhkan ko-faktor; magnesium untuk fungsinya. Taq polimerase tidak memiliki kemampuan proofreading 3 '- 5', oleh karena itu, tingkat kesalahan Taq DNA polimerase tinggi dibandingkan dengan jenis DNA polimerase yang lebih baru seperti Phusion polimerase dll. Namun, popularitas Taq DNA polimerase tetap menjadi sama di seluruh dunia sains karena kenyamanan dan fleksibilitas enzim.
Phusion vs Taq Polymerase | |
Phusion adalah DNA polimerase yang diisolasi dari Pyrococcus furiosus dan terutama digunakan dalam percobaan kloning untuk meningkatkan kesetiaan. | Taq DNA Polymerase adalah DNA polimerase standar yang digunakan dalam Polymerase Chain Reaction (PCR), dan diisolasi dari bakteri termostabil, Thermus aquaticus. |
Sumber Organisme | |
Phusion diekstraksi dari arkaea ekstrofilik - Pyrococcus furiosus. | Karya-karya sastra ini merentang dari periode kolonisasi hingga periode dekolonisasi. |
Kemampuan membaca bukti | |
3 '- 5' kemampuan membaca bukti ada di Phusion. | Kemampuan membaca 3 '- 5' tidak ada dalam Taq polimerase. |
Kesetiaan | |
Kesetiaan tinggi ada dengan Phusion. | Taq polimerase menunjukkan kesetiaan yang rendah. |
Amplifikasi | |
Phusion mampu memperkuat fragmen DNA yang panjang. | Taq polimerase mampu memperkuat fragmen DNA yang jauh lebih pendek. |
Keracunan dUTP | |
Tindakan fusi dihambat oleh akumulasi ganjil. | Taq polimerase tidak dihambat oleh dUPT. |
Phusion dan Taq DNA polimerase adalah dua polimerase stabil panas yang digunakan dalam teknik PCR. Phusion adalah polimerase yang diisolasi dari ekstrofil, Pyrococcus furiosus sedangkan, Taq diisolasi dari bakteri termostabil Thermus aquaticus. Penemuan DNA polimerase Taq mengarah ke penemuan PCR. Phusion memiliki banyak keunggulan dibandingkan Taq yang menjadikan Phusion pilihan yang lebih baik dalam menghasilkan DNA dengan kesetiaan tinggi. Namun, Taq polimerase masih digunakan sebagai enzim polimerase standar dalam PCR. Ini adalah perbedaan antara Phusion dan Taq polimerase.
1.Biolabs, New England. "Taq DNA Polymerases." New England Biolab: Reagen untuk Industri Ilmu Hayati. Tersedia disini
2. "Phusion DNA Polymerase." Biolab Inggris Baru. Tersedia disini
1.'GAM diilustrasikan oleh Nivin Nasri'By NivinN - Pekerjaan sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia
2.'Taq'By Adenosine - Pekerjaan sendiri, (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia