Perbedaan antara lophotrochozoa dan ecdysozoa, keduanya utama bilaterian, dibahas dalam artikel ini. Berdasarkan studi baru-baru ini menggunakan urutan DNA nuklir dan mitokondria, para ilmuwan merevisi taksonomi Kerajaan Hewan. Menurut filogeni molekuler baru, para ilmuwan mengidentifikasi deuterom sebagai kelompok alami yang terpisah. Selain itu, kelompok utama protostom sekarang dibagi menjadi dua kelompok bilaterian monofiletik yang disebut Lophotrochozoa dan Ecdysozoa. Oleh karena itu, Kerajaan Hewan sekarang terdiri dari tiga clade monofiletik utama hewan bilateral; lophotrochozoa, ecdysozoa, dan deuterstomia. Dueterostomia clade selanjutnya dibagi menjadi dua subkelompok; (a) ambulacraria, yang meliputi echinodermata, dan (b) chordate, yang terdiri dari urochordate, cephalochordate dan vertebrata. Lophotrochozoa dan ecdysozoa dibagi lagi menjadi lebih banyak dan lebih banyak subkelompok berdasarkan pada filogeni molekuler mereka.
Ciri-ciri khas dari kelompok lophotrochozoa adalah adanya a larva trochophore dan struktur makan disebut lofofor. Namun, hanya sedikit lophotrochozoans yang memiliki kedua fitur karakteristik ini. Lophotrochozoans direproduksi secara seksual dengan melepaskan gamet mereka ke lingkungan. Reproduksi aseksual juga umum dalam kategori ini. Setiap anggota kelompok ini triploblastik dan menunjukkan simetri bilateral. Spesies darat dan perairan ditemukan dalam kelompok ini. Lophotrochozoa dibagi menjadi enam subkelompok; (a) Cacing pipih (Platyhelminthes, yang meliputi turbellarians, trematoda, dan cestode), (b) Nemerteans (cacing pita), Moluska (chiton, gastropoda seperti siput, siput, nudibranch, bivalvia seperti kerang dan tiram, cumi-cumi seperti cumi-cumi dan cumi-cumi) ), (c) Annelids (polychaetes seperti cacing pasir dan cacing tabung, oligochaetes termasuk cacing tanah dan cacing air tawar, hirudinids, yang termasuk lintah), (d) Lophophorate (branchipods, phoronid, dan bryozoa), dan (e) Rotifera (hewan roda).
Nama ecdysozoan diberikan kepada kelompok hewan ini karena adanya hormon steroid khusus yang disebut ecdysteroids, yang mengontrol proses yang disebut ekdisis atau metamorfosis. Ecdysozoans memiliki kerangka kutikula dan mampu melepaskan kerangka melalui ekdisis. Sebagian besar anggota dalam kelompok ini memiliki jenis kelamin yang berbeda. Selama reproduksi seksual, pejantan menyimpan sperma di dalam tubuh betina. Banyak ecdysozoans adalah spesies soliter, sedangkan beberapa spesies hidup dalam koloni. Spesies tertentu menunjukkan reproduksi aseksual melalui partenogenesis.
Subkelompok utama ecdysozoan termasuk nematoda (cacing gelang), onychophoran (cacing beludru), tardigrades ("beruang air"), dan arthropoda. Phylum Arthropoda adalah kelompok terbesar dengan jumlah spesies tertinggi dan sebagian besar terdiri dari myriapods (lipan, millipedes), chelicerate (kepiting tapal kuda, arakhnida), krustasea (lobster, kepiting, teritip, copepoda), dan hexapoda (serangga).
• Ecdysozoans memiliki kemampuan untuk melepaskan exoskeleton mereka beberapa kali sepanjang hidup mereka, sedangkan lophotrochozoan adalah hewan yang memiliki larva trochophore dan struktur makan yang disebut lophophore.
• Berbeda dengan lophotrochozoan, ecdysozoans memiliki hormon steroid khusus yang disebut ecdysteroid.
• Ecdysozoa termasuk nematoda, arthropoda, onikoforan, dan tardigrades, sedangkan lophotrochozoan termasuk cacing pipih, nemerteans, moluska, annelid, lophophorate, dan rotifer.