Perbedaan Antara Genotipe dan Sequencing

Perbedaan Utama - Genotipe vs Sekuensing
 

Genotipe dan pengurutan adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan informasi tentang asam nukleat, terutama DNA dari suatu organisme. Perbedaan utama antara genotipe dan pengurutan adalah genotyping adalah proses menentukan varian genetik mana yang dimiliki individu menggunakan penanda sementara pengurutan adalah penentuan urutan yang benar dari urutan nukleotida dalam fragmen DNA yang diberikan.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Genotyping
3. Apa itu Sequencing
4. Perbandingan Berdampingan - Genotyping vs Sequencing
5. Ringkasan

Apa itu Genotyping??

Genotyping adalah penentuan susunan genetik individu menggunakan urutan DNA dan penanda serta perbandingan dan identifikasi pewarisannya. Genotipe penting dalam biologi evolusi, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetika organisme. Hal ini dapat dilakukan dengan teknik yang berbeda termasuk sekuensing DNA, reaksi berantai polimerase, polimorfisme panjang fragmen restriksi (RFLP), deteksi polimorfik acak yang diamplifikasi, polimorfisme panjang fragmen yang diamplifikasi (AFLP), microarray DNA, dll..

Genotipe melibatkan pengurutan fragmen kecil tertentu dari sekuens DNA dan penemuan keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain menggunakan penanda genetik. Ini menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di antara individu atau alel spesifik. Genotip berlaku untuk berbagai organisme termasuk manusia. Ini juga berlaku untuk mikroorganisme seperti virus, jamur dll. Dan dapat digunakan untuk menentukan varian genetiknya dengan profil referensi. Dalam epidemiologi molekuler dan mikrobiologi forensik, pengendalian patogen, terutama mikroorganisme, dilakukan dengan informasi yang diperoleh dari genotipe. Genotipe sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia memiliki genotipe untuk mengkonfirmasi peran sebagai ibu dan ayah. Genotipe akan mengungkapkan alel gen dominan dan resesif yang menentukan sifat-sifat tertentu.

Gambar_1: Genotip RFLP

Apa itu Sequencing?

Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua informasi yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan suatu organisme dikodekan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan beberapa ratus nukleotida fragmen asam nukleotida panjang mengarah pada pengembangan prosedur penentuan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Berbagai jenis metode pengurutan tersedia saat ini. Metode pengurutan ini, bersama dengan teknologi untuk pembangunan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom suatu organisme, memfasilitasi pengurutan seluruh genom organisme itu, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, daerah pengaturan gen dll.

Total genom dari banyak virus, beberapa bakteri, archaebacteria, ragi dan beberapa organisme lain telah diurutkan dan dipetakan. Proyek genom manusia telah memungkinkan untuk mengurutkan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan konsep pertamanya pada tahun 2003. Ini adalah tonggak utama dalam kemajuan biologi. Sekuens genom manusia sekarang digunakan di sektor medis untuk mengidentifikasi penyebab genetik penyakit langka, menyaring risiko penyakit pada bayi baru lahir, mengidentifikasi detail genetik berbagai jenis kanker, mengembangkan terapi baru, dan mengembangkan alat diagnostik baru, dll..

Di dunia tanaman, genom padi dan genom Arabidopsis telah diurutkan. Pengetahuan tentang urutan ini tidak diragukan lagi akan merevolusi pemahaman kita tentang bagaimana sel dan organisme berfungsi.

Gambar_2: Autoradiograf dari sekuensing sanger

Apa perbedaan antara Genotyping dan Sequencing?

Genotyping vs Sequencing
Genotipe adalah proses menentukan komposisi genetik seseorang dan memeriksa kelompok atau taksonomi organisme itu.	Sequencing adalah proses penentuan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan.
Teknik
RFLP, sequencing Gene, PCR, microarrays DNA, AFLP dll.	Sequencing Sanger, Sequencing Gilbert, Pyrosequencing, Sequencing Generasi Selanjutnya, Sequencing Shotgun dll.
Kekhawatiran Besar
Ini lebih mengkhawatirkan apakah perbedaan genotip memberikan perbedaan fenotip yang sebenarnya.	Ini lebih mementingkan urutan nukleotida dan perbedaannya dan perubahan dengan organisme lain.

Ringkasan - Genotyping vs Sequencing

Genotipe dan pengurutan berguna untuk mempelajari informasi genetik organisme. Genotyping adalah proses menentukan variasi genotipe di antara individu dan menemukan kategorinya. Sequencing adalah proses penentuan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen yang tertarik atau wilayah DNA. Kedua teknik memberikan informasi penting tentang gen dan genom.

Referensi:
1. "Metode Genotyping." Metode dalam biologi molekuler (Clifton, N.J.). Perpustakaan Kedokteran Nasional A.N., n.d. Web. 20 Februari 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, dan M. D. Shriver. "Analisis Kurva Melting SNPs (McSNP ): Pendekatan Gel-Gratis dan Murah untuk Genotipe SNP." Teknik Bio 30.2 (2001): 358-67. Web.

Gambar milik:
1. "Genotip RFLP" Oleh (tidak diketahui) - Institut Kesehatan Nasional (Domain Publik) via Commons Wikimedia
2. "Radioactive Fluorescent" Oleh Abizar di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia