Perbedaan Antara DNA Genomik dan Isolasi DNA Plasmid

Itu perbedaan utama antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid adalah bahwa isolasi DNA genom menargetkan ekstraksi DNA genom sedangkan isolasi DNA plasmid menargetkan ekstraksi DNA plasmid bakteri.

Isolasi DNA adalah proses kimia yang digunakan untuk mengisolasi DNA dari spesies yang berbeda atau dari sampel yang berbeda. Isolasi DNA penting dalam teknik biologi molekuler hilir, seperti elektroforesis gel, reaksi berantai polimerase dan teknik pengurutan DNA. Oleh karena itu, isolasi DNA adalah proses kimia penting dalam studi biologi molekuler. Berdasarkan tujuan penelitian, terkadang perlu untuk mengisolasi DNA genom. Selain itu, beberapa penelitian fokus pada isolasi DNA plasmid dari bakteri. Isolasi DNA genomik adalah proses mengisolasi DNA genomik dari sampel prokariotik atau eukariotik. Langkah-langkah isolasi berbeda sesuai dengan jenis sel di mana DNA diisolasi. Isolasi DNA plasmid adalah proses mengisolasi DNA plasmid dari sel bakteri. Dibandingkan dengan isolasi DNA genom, proses keseluruhannya kompleks dalam isolasi DNA plasmid.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Isolasi DNA Genomik
3. Apa itu Isolasi DNA Plasmid
4. Kesamaan Antara DNA Genomik dan Isolasi DNA Plasmid
5. Perbandingan Berdampingan - DNA Genomik vs Isolasi DNA Plasmid dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Isolasi DNA Genomik??

Isolasi DNA genomik adalah proses mengekstraksi DNA genom seluruh organisme. Proses khusus ini melibatkan tiga peristiwa utama. Yaitu, lisis sel atau lisis nuklir, degradasi protein atau proteolisis dan pengendapan DNA genom. Langkah lisis mungkin berbeda sesuai dengan jenis sel. Pada prokariota, karena ada dinding sel peptidoglikan, langkah pertama adalah pemecahan dinding sel. Di sisi lain, pada eukariota, langkah lisis melibatkan pemecahan membran plasma dan membran nuklir untuk mengeluarkan DNA ke luar. Sebaliknya, langkah-langkah khusus sangat penting untuk melisiskan tanaman dan dinding sel jamur.

Gambar 01: Isolasi DNA Genomik

Akibatnya, setelah langkah lisis selesai, akhirnya DNA akan datang ke supernatan. Secara bersamaan, degradasi protein juga terjadi dalam larutan karena penambahan proteinase K. Langkah selanjutnya adalah memisahkan DNA genom dan protein terdegradasi satu sama lain. Oleh karena itu, protein terdegradasi terpisah oleh pengendapan memungkinkan DNA genom tetap berada di supernatan. Setelah pengendapan protein, DNA genom dapat diendapkan dan ditangguhkan kembali dalam buffer yang sesuai sampai diperlukan untuk percobaan..

DNA genom, yang merupakan DNA linier, mengandung semua informasi genetik suatu organisme. Dengan kata lain, genom adalah bahan keturunan dari organisme hidup yang bertanggung jawab atas semua aktivitas struktural dan fungsional sel. Ini terdiri dari urutan DNA pengkodean dan non-pengkodean. Ketika mengisolasi DNA genom, itu mencakup seluruh genom organisme.

Apa itu Isolasi DNA Plasmid?

Isolasi DNA plasmid adalah proses isolasi DNA khusus dan lebih rumit. Plasmid adalah DNA ekstrachromosomal yang ada di sebagian besar sel bakteri. Mereka adalah DNA sirkular aktif yang mendukung bakteri untuk bertahan hidup dalam kondisi lingkungan yang keras. DNA plasmid terdiri dari gen tahan khusus yang memberikan keuntungan tambahan bagi bakteri seperti resistensi antibiotik, sifat virulensi dan sifat toksik.

Gambar 02: Isolasi DNA Plasmid

Isolasi DNA plasmid juga melibatkan tiga proses utama; lisis sel, proteinolisis dan presipitasi DNA. Meskipun mekanisme biokimia isolasi mirip dengan isolasi DNA genom, prosesnya lebih kompleks daripada itu. Proses lisis sel adalah proses yang paling penting dalam prosedur ini. Yang paling penting, DNA genomik dan DNA plasmid tidak boleh dicampur satu sama lain. Oleh karena itu, proses lisis yang jauh lebih ringan dimasukkan ke dalam prosedur isolasi DNA plasmid. Karenanya, dalam kebanyakan prosedur isolasi DNA plasmid gunakan deterjen; sodium dodecyl sulfate untuk lisis sel.

Apa Persamaan Antara Genomik DNA dan Isolasi DNA Plasmid?

• DNA Genomik dan isolasi DNA Plasmid fokus pada ekstraksi DNA suatu organisme.
• Juga, keduanya mengikuti proses keseluruhan yang sama yang meliputi lisis sel, degradasi protein dan pengendapan DNA.
• Selanjutnya, DNA yang dihasilkan dari kedua proses penting untuk proses hilir.
• Selain itu, kedua proses isolasi mencakup langkah-langkah untuk memurnikan dan menyimpan DNA dalam kondisi penyimpanan yang ditentukan.
• Selain itu, proteinase K digunakan dalam kedua metode untuk mendegradasi protein.

Apa Perbedaan Antara DNA Genomik dan Isolasi DNA Plasmid?

Isolasi DNA genomik berfokus pada ekstraksi seluruh DNA genomik organisme target, sedangkan isolasi DNA plasmid berfokus pada mengisolasi hanya DNA plasmid dari spesies bakteri tertentu. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid. Selain itu, perbedaan lain antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid adalah dalam prosedur. Isolasi DNA genom adalah prosedur yang kurang kompleks dibandingkan dengan isolasi DNA plasmid. Oleh karena itu, ketika mengisolasi DNA plasmid, perlu dilakukan tindakan pencegahan untuk mencegah pencampuran DNA genom dan plasmid satu sama lain..

Infograohic di bawah ini memberikan perincian lebih lanjut tentang perbedaan antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid.

Ringkasan - DNA Genomik vs Isolasi DNA Plasmid

Isolasi DNA adalah proses penting dalam teknik biologi molekuler. Ada dua jenis DNA yaitu DNA genom dan DNA plasmid (DNA ekstra-kromosom). Berdasarkan persyaratan, beberapa prosedur dilakukan untuk mengisolasi DNA genom sementara beberapa prosedur fokus untuk mengisolasi hanya DNA plasmid dari bakteri. Oleh karena itu, langkah-langkah yang terlibat dalam kedua proses sedikit berbeda satu sama lain. Namun, keseluruhan prosesnya sama di kedua isolasi. DNA yang terisolasi dari kedua proses memiliki penggunaan yang sangat besar dalam proses hilir seperti kloning, elektroforesis gel dan reaksi rantai polimerase. Pada akhir protokol isolasi DNA genom, seluruh DNA genom organisme dapat diisolasi sebagai produk akhir sementara pada akhir protokol isolasi DNA plasmid, DNA plasmid dari masing-masing bakteri dapat diisolasi sebagai produk akhir. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan antara DNA genom dan isolasi DNA plasmid.

Referensi:

1. "EKSTRAKSI DNA DARI BAKTERI." Ekstraksi DNA dari Bakteri. Tersedia disini 

Gambar milik:

1. "Ekstraksi DNA" Oleh Joo Nath - Pekerjaan sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia 
2. "Plasmid miniprep" Oleh Retama - Pekerjaan sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Commons Wikimedia