Perbedaan Antara Gene Knockout dan Knockdown

Itu perbedaan utama antara knockout gen dan knockdown adalah bahwa knockout gen adalah teknik di mana gen yang diinginkan sepenuhnya dihilangkan (keadaan tidak aktif) untuk mempelajari fungsi gen sementara knockdown gen adalah teknik lain di mana gen yang diinginkan dibungkam untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis.

Teknik genetik yang berbeda sedang beroperasi untuk menyelidiki fungsi gen dalam sistem biologis yang hidup. Knockout dan knockdown gen adalah dua teknik tersebut. Teknik-teknik ini membantu para ilmuwan untuk mengidentifikasi aspek-aspek fungsional dari berbagai gen dalam organisme hidup.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Gene Knockout
3. Apa itu Gene Knockdown
4. Kesamaan Antara Gene Knockout dan Knockdown
5. Perbandingan Berdampingan - Gene Knockout vs Knockdown dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Gene Knockout?

KO gen adalah teknik genetik yang membuat satu atau lebih gen tidak bekerja pada organisme hidup. Ini juga merupakan proses mematikan atau menghapus gen suatu organisme. Aplikasi utama dari teknik ini adalah untuk mempelajari fungsi gen. Proses mengevaluasi efek dari gen yang hilang atau dihilangkan. Proses KO juga melibatkan enzim tertentu dan teknik penyambungan.

Gambar 01: Gene Knockout

Ada beberapa variasi dalam teknik knockout gen berdasarkan jumlah gen yang terlibat. Mereka KO ganda (KO dua gen), KO tiga kali lipat (KO tiga gen) dan KO empat kali lipat (KO empat gen). Sistem gugur gen selanjutnya diklasifikasikan menjadi dua kelompok; KO heterozigot dan KO KO homozigot.

Apa itu Gene Knockdown?

Knockdown gen adalah prosedur eksperimental di mana prosedur ini menekan atau mengurangi ekspresi gen tertentu atau gen suatu organisme. Gen membungkam adalah definisi umum untuk knockdown gen. Selama prosedur ini, aktivasi atau degradasi mRNA yang dihasilkan melibatkan gangguan RNA (RNAi), RNA kecil yang mengganggu (siRNA) dan RNA jepit rambut pendek (shRNA).

Gambar 02: Membungkam Gen

Penggunaan utama knockdown gen adalah untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis. Oleh karena itu, teknik ini menyelesaikan studi onkogen (Bcl-2 dan P53) dan gen yang menyebabkan penyakit neurologis, infeksi virus, dan penyakit keturunan..

Apa Persamaan Antara Gene Knockout dan Knockdown?

• Baik knockout gen dan knockdown gen adalah teknik genetik.
• Dua teknik ini dapat mencegah ekspresi gen.
• Penggunaan utama kedua teknik ini adalah untuk menyelidiki fungsi gen yang diinginkan.
• Keduanya mampu mengidentifikasi berbagai kondisi penyakit (genetik).
• Keduanya dapat dimanfaatkan untuk satu atau lebih gen yang diinginkan.

Apa Perbedaan Antara Gene Knockout dan Knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
Gene KO adalah in-operasi gen (penghapusan gen dari DNA) dari suatu organisme melalui teknik genetik yang berbeda.	Gene knockdown adalah prosedur eksperimental untuk menekan (mengurangi atau membungkam) ekspresi gen tertentu atau gen suatu organisme.
Fungsi
Memfasilitasi studi fungsi gen dengan menganalisis hasil gen yang hilang.	Memfasilitasi studi onkogen, gen yang menyebabkan penyakit neurologis, infeksi virus, dan penyakit keturunan.
Keterlibatan Agen RNA
Keterlibatan agen RNA tidak signifikan dalam teknik ini.	Proses ini melibatkan agen seperti siRNA, shRNA, dan RNAi untuk menonaktifkan mRNA.
Penggunaan Agen Kimia
Agen enzimatik digunakan.	Tidak ada bahan kimia yang digunakan.
Efek pada Gene
Benar-benar menghilangkan gen dari DNA.	Menekan atau membungkam gen.
Klasifikasi
KO ganda, KO tiga kali lipat dan KO empat kali lipat dan KO heterozigot dan homozigot adalah berbagai jenis KO gen..	Tidak ada sistem klasifikasi yang tersedia untuk pembungkaman gen.

Ringkasan - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Dua teknik yang kami diskusikan di sini; knockout dan knockdown gen, adalah metode untuk menyelidiki fungsi gen yang berbeda. KO gen benar-benar membuat gen tidak beroperasi sementara knockdown gen membungkam gen yang diinginkan. Namun, kedua prosedur tersebut mencegah ekspresi gen. Agen yang berbeda mampu menyelesaikan dua proses ini. Knockout gen adalah jenis penghapusan sedangkan knockdown gen adalah tipe inaktivasi. Inilah perbedaan antara gen knock out dan knockdown.

Referensi:

1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout versus Knockdown." News-Medical.net, 12 Februari 2018. Tersedia di sini  
2. "Gene Knockout." Berita Alam, Grup Penerbitan Alam. Tersedia disini

Gambar milik:

1.'Knockout Mice5006-300'Dengan Maggie Bartlett, NHGRI. (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia 
2.'RNAi-disederhanakan'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Menanam Benih Paradigma Baru. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) via Commons Wikimedia