Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan SDS

Perbedaan Kunci - Gel Elektroforesis vs SDS Halaman
 

Gel elektroforesis adalah teknik yang memisahkan makromolekul dalam medan listrik. Ini adalah metode umum dalam biologi molekuler untuk memisahkan DNA, RNA dan protein dari campuran sesuai dengan ukuran molekulnya. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein dari campuran protein berdasarkan ukurannya. Elektroforesis gel adalah istilah yang digunakan untuk merujuk pada teknik normal yang diterapkan untuk pemisahan DNA, RNA, dan protein sementara SDS Page adalah satu jenis elektroforesis gel. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel dan SDS Halaman.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Elektroforesis Gel
3. Apa itu SDS Page
4. Perbandingan Berdampingan - Elektroforesis Gel vs Halaman SDS
5. Ringkasan

Apa itu Elektroforesis Gel?

Elektroforesis gel adalah teknik umum yang digunakan di laboratorium untuk memisahkan molekul bermuatan seperti DNA, RNA, protein, dll. Dari campurannya. Gel digunakan dalam elektroforesis gel. Ini bertindak sebagai saringan molekuler. Ada dua jenis gel yang digunakan dalam elektroforesis gel yaitu agarosa dan poliakrilamida. Pemilihan gel dan preparasi gel adalah faktor penting untuk dipertimbangkan dalam elektroforesis gel karena ukuran pori gel harus dimanipulasi dengan hati-hati untuk pemisahan molekul yang baik melalui elektroforesis gel. Elektroforesis gel memiliki medan listrik yang terhubung ke dua ujung gel. Salah satu ujung gel menunjukkan muatan positif sedangkan ujung lainnya bermuatan negatif.

DNA dan RNA adalah molekul bermuatan negatif. Begitu mereka dimasukkan ke dalam gel dari ujung negatif gel dan diterapkan ke medan listrik, mereka bermigrasi melalui pori-pori gel menuju ujung gel yang bermuatan positif. Kecepatan migrasi tergantung pada muatan dan ukuran molekul. Molekul yang lebih kecil mudah bermigrasi melalui pori-pori gel daripada molekul yang lebih besar. Karenanya, molekul yang lebih kecil menempuh jarak yang jauh melalui gel dan molekul yang lebih besar menempuh jarak yang pendek. Untuk mengamati perjalanan molekul pada gel, digunakan jenis pewarna khusus. Medan listrik diterapkan untuk periode waktu tertentu dan berhenti untuk mencegah hilangnya molekul dan menjaga molekul pada posisi yang dilalui. Pita yang berbeda dapat diamati dalam gel. Pita-pita ini mewakili molekul dengan ukuran berbeda. Karenanya, elektroforesis gel berguna untuk membedakan molekul berdasarkan ukurannya.

Elektroforesis gel dimasukkan ke dalam berbagai teknik sebagai teknik persiapan dalam biologi molekuler seperti PCR, RFLP, kloning, sekuensing DNA, blotting selatan, pemetaan genom, dll..

Gambar 01: Elektroforesis gel agarosa

Apa itu SDS Page?

Elektroforesis gel natrium dodesil sulfat poliakrilamid (SDS Page) adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein. Ketika gel elektroforesis digunakan untuk memisahkan protein, diperlukan perawatan khusus karena protein tidak bermuatan negatif seperti DNA dan RNA dan tidak bermigrasi ke ujung positif atau negatif. Karenanya, protein didenaturasi dan dilapisi dengan muatan negatif sebelum elektroforesis gel. Ini dilakukan dengan menggunakan deterjen yang disebut sodium dodecyl sulfate (SDS). Elektroforesis gel yang menggunakan SDS dan gel poliakrilamida untuk media pendukung dikenal sebagai SDS. Teknik ini biasa digunakan dalam biokimia, genetika, forensik dan biologi molekuler.

Selama Halaman SDS, protein dicampur dengan SDS. SDS membuka protein menjadi bentuk linier dan melapisi mereka dengan muatan negatif sebanding dengan massa molekulnya. Karena muatan negatif, molekul protein bermigrasi ke arah ujung muatan positif gel dan berpisah sesuai dengan massa molekulnya. Dalam SDS Page, poliakrilamid digunakan sebagai pendukung padat untuk gel. Pemisahan sebenarnya dari protein terutama tergantung pada sifat-sifat gel. Oleh karena itu, persiapan gel poliakrilamida harus dilakukan dengan hati-hati dan konsentrasi poliakrilamida yang benar harus digunakan. Gel poliakrilamida menunjukkan resolusi tinggi daripada gel agarosa. Oleh karena itu, SDS Page dianggap sebagai teknik resolusi tinggi untuk pemisahan protein.

SDS Page adalah jenis elektroforesis denaturasi gel. Ini memiliki batasan utama dalam analisis protein. Karena SDS mendenaturasi protein sebelum pemisahan, itu tidak memungkinkan deteksi aktivitas enzimatik, interaksi pengikatan protein, kofaktor protein, dll.

Gambar 02: Halaman SDS

Apa perbedaan antara Elektroforesis Gel dan SDS Halaman?

Gel Electrophoresis vs SDS Halaman
Elektroforesis gel adalah metode yang dilakukan untuk memisahkan makromolekul menggunakan medan listrik.	SDS Page adalah teknik elektroforesis gel resolusi tinggi yang digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan massanya.
Gel Run
Ini dapat dilakukan secara horizontal atau vertikal.	Halaman SDS selalu berjalan secara vertikal.
Dasar Pemisahan
Pemisahan terjadi sesuai dengan muatan dan ukuran.	Pemisahan protein terjadi sesuai dengan massa dan muatan.
Resolusi
Elektroforesis gel agarosa memiliki resolusi rendah dan elektroforesis gel poliakrilamida memiliki resolusi yang lebih tinggi	Halaman SDS memiliki resolusi yang lebih baik.
Denaturasi
Elektroforesis gel mencakup teknik denaturasi dan non denaturasi.	Halaman SDS mendenaturasi protein sebelum pemisahan.

Ringkasan - Gel Elektroforesis vs SDS Halaman

Elektroforesis gel adalah teknik yang umum digunakan untuk pemisahan dan analisis DNA, RNA, dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Ada dua jenis utama elektroforesis gel yaitu elektroforesis gel agarosa dan elektroforesis gel poliakrilamida. Gel agarose digunakan terutama untuk pemisahan asam nukleat; ketika resolusi yang lebih tinggi diperlukan, gel poliakrilamid digunakan. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang biasa digunakan untuk memisahkan campuran protein kompleks. Ini dianggap sebagai teknik pemisahan protein resolusi tinggi. Ini adalah perbedaan antara elektroforesis gel dan SDS Halaman.

Referensi:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig, dan David H. Petering. “Native SDS-PAGE: Pemisahan Protein Elektroforesis Resolusi Tinggi Dengan Retensi Properti Asli Termasuk Ion Logam Terikat. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., Mei 2014. Web. 7 April 2017
2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforesis DNA dalam gel agarosa, gel poliakrilamida dan dalam larutan bebas." Elektroforesis. Perpustakaan Kedokteran Nasional A.S., Juni 2009. Web. 07 April 2017

Gambar milik:
1. "Gelelektrophoreseapparatur" (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia
2. “DNA Agarose gel electrophoresis” Oleh School of Natural Resources dari Ann Arbor - laboratorium DNA (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia