Perbedaan Antara Forward dan Reverse Primer

Perbedaan Utama - Maju vs Reverse Primer
 

Polymerase chain reaction (PCR) adalah metode amplifikasi DNA yang digunakan dalam aplikasi Biologi Molekuler. Ini adalah teknik yang umum digunakan yang menghasilkan jutaan hingga miliaran salinan urutan DNA yang sangat tertarik. Ini adalah sebuah in vitro metode yang dilakukan di laboratorium. Teknik PCR benar-benar tergantung pada DNA polimerase yang diproduksi secara komersial yang disebut Taq polimerase. Dan juga membutuhkan beberapa komponen lain dan pemeliharaan suhu yang tepat. Salah satu komponen penting adalah primer. Primer adalah sekuens DNA pendek yang dirancang khusus untuk sekuens DNA target. Panjangnya biasanya sekitar 20 nukleotida. Taq polimerase mengkatalisasi penambahan nukleotida ke dalam urutan nukleotida yang sudah ada sebelumnya. Oleh karena itu, primer disajikan sebagai titik awal sintesis untaian baru. Taq polimerase hanya bekerja dalam arah 5 'hingga 3' sehingga sintesis DNA terjadi dalam arah 5 'hingga 3' yang sama. Karena DNA beruntai ganda, dua jenis primer diperlukan dalam PCR. Mereka dikenal sebagai primer maju dan primer terbalik. Primer maju dan mundur disebut berdasarkan arah perpanjangan primer dalam DNA ketika sintesis DNA terjadi. Meneruskan anil primer dengan untai DNA antisense dan memulai sintesis + untai gen ke arah 5 'ke 3'. Membalik anil primer dengan untai indera dan memulai sintesis untai komplementer untai pengkodean; yaitu -ve untai gen ke arah 5'to 3 '. Ini adalah perbedaan utama antara primer maju dan mundur.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Forward Primer
3. Apa itu Reverse Primer
4. Kesamaan Antara Forward dan Reverse Primer
5. Perbandingan Berdampingan - Maju vs Reverse Primer dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Forward Primer?

Orientasi ke depan adalah sintesis dari untaian kode atau untai arti dari suatu gen. Taq polimerase mengkatalisasi sintesis untai baru dalam arah 5 'ke 3'. Sintesis untai pengkodean terjadi ketika primer anil dengan untai pengkodean atau antisense dan memanjang dalam arah 5 'sampai 3'.

Gambar 01: Primer Maju dan Mundur

Primer yang dianil dengan untai antisense atau untai nonkoding atau untai templat dikenal sebagai forward primer karena forward primer bertindak sebagai titik awal untuk sintesis pengkodean atau untai positif dari gen. Maju primer memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit 3 'dari untai antisense. Ini berhibridisasi dengan untai antisense dan memfasilitasi Taq polimerase untuk menambahkan nukleotida yang saling melengkapi dengan untai cetakan..

Apa itu Reverse Primer?

Reverse primer adalah urutan DNA pendek yang dianil dengan ujung 3 'dari untai indera atau untai kode. Reverse primer berfungsi sebagai titik awal untuk mensintesis untai komplementer dari urutan pengkodean atau urutan nonkode. Reverse primer dirancang komplementer ke ujung 3 'dari untai pengkodean. Oleh karena itu, ia dianil dengan ujung 3 'dari untaian kode dan memungkinkan Taq polimerase untuk mensintesis untai antisense atau untai templat. Karena orientasinya terbalik, primer ini diberi label sebagai primer terbalik.

Primer mundur dan maju penting untuk menghasilkan jutaan hingga milyaran salinan wilayah DNA tertentu yang ditargetkan atau diminati.

Apa Persamaan Antara Maju dan Mundur Primer?

  • Primer Maju dan Mundur terbuat dari oligonukleotida.
  • Primer Maju dan Terbalik memiliki sekuens nukleotida pendek yang saling melengkapi pada ujung-ujung helai ganda DNA.
  • Primer Forward dan Reverse biasanya terdiri dari 20 nukleotida.
  • Primer Maju dan Terbalik digunakan dalam reaksi berantai polimerase.
  • Forward Primer dan Reverse Primer disintesis secara komersial.
  • Primer Forward dan Reverse keduanya stabil suhu dan mereka biasanya memiliki Tm yang sama.
  • Primer Maju dan Terbalik dianil dengan urutan DNA target.
  • Forward Primer dan Reverse Primer dirancang sesuai dengan reaksi PCR.
  • Forward Primer dan Reverse Primer berfungsi sebagai titik awal untuk amplifikasi DNA.
  • Primer terbalik dan maju penting untuk menghasilkan jutaan salinan wilayah tertentu dari sekuens DNA yang ditargetkan atau tertarik.

Apa Perbedaan Antara Maju dan Mundur Primer?

Forward Primer vs Reverse Primer

Forward primer adalah urutan DNA pendek yang berhibridisasi dengan ujung 3 'dari noncoding atau untai templat gen dan berfungsi sebagai titik awal untuk mensintesis urutan pengkodean. Reverse primer adalah urutan DNA pendek yang berhibridisasi dengan ujung kode 3 'atau untai nontemplate dan berfungsi sebagai titik awal untuk mensintesis urutan nonkode.
 Annealing Strand
Teruskan anil primer dengan untai templat. Membalikkan anil primer dengan untai nontemplate.
Menghasilkan Urutan Baru
Forward primer memfasilitasi sintesis urutan pengkodean. Reverse primer memfasilitasi sintesis urutan nonkode.

Ringkasan - Maju vs Reverse Primer

Ada dua jenis primer yang terlibat dalam teknik PCR. Mereka maju dan mundur primer. Berdasarkan perpanjangan primer dalam sintesis untai DNA baru, primer ini diberi label atau dinamai. Taq polimerase mensintesis DNA baru dalam orientasi 5 'sampai 3'. Oleh karena itu, primer dirancang sebagai pelengkap ujung 3 'dari untaian ganda. Maju primer yang memanjang dalam arah 5 'ke 3' berhibridisasi dengan ujung 3 'dari antisense atau templat atau urutan nonkode. Ini berfungsi sebagai titik awal untuk mensintesis urutan pengkodean. Membalikkan primer yang memanjang dalam arah 5 'ke 3' berhibridisasi dengan ujung pengkodean 3 'atau nontemplate atau untai indra. Ini berfungsi sebagai titik awal untuk mensintesis urutan noncoding. Ini adalah perbedaan antara primer maju dan mundur.

Referensi:

1. "Primer (biologi molekuler)." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 20 Februari 2018. Tersedia di sini 
2. "Reaksi rantai Polymerase (PCR)." Akademi Khan. Tersedia disini 

Gambar milik:

1.'Primers RevComp Melted2'By Richard Wheeler (Zephyris) - Pekerjaan sendiri, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia