Perbedaan Antara IKAN dan CGH

Itu perbedaan utama antara IKAN dan CGH adalah itu FISH adalah teknik molekuler yang mendeteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresensi, sedangkan CGH adalah teknik sitogenetik molekuler lain yang mendeteksi perubahan dalam DNA genomik..

Analisis sitogenetik memainkan peran penting dalam kedokteran ketika mendeteksi kelainan kromosom seperti aneuploidies, penghapusan, duplikasi, dan penyusunan ulang, dll. Kelainan kromosom pada akhirnya menyebabkan penyakit genetik seperti kanker, infertilitas, sindrom Down, sindrom Klinefelter, sindrom Turner, leukemia, dll. Ada berbagai metode sitogenetik molekuler untuk mendeteksi cacat dan penyakit yang disebutkan di atas. Di antara mereka, FISH (hibridisasi fluorescent in situ) dan CGH (hibridisasi genomik komparatif) adalah dua teknik hibridisasi yang kuat. Namun, kedua metode tersebut memiliki pro dan kontra.

ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu IKAN 
3. Apa itu CGH
4. Kesamaan Antara IKAN dan CGH
5. Perbandingan Berdampingan - IKAN vs CGH dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan

Apa itu IKAN?

IKAN adalah teknik hibridisasi asam nukleat yang dilakukan pada sebagian atau sebagian jaringan, di seluruh jaringan atau sel. Ini adalah metode berbasis probe. Teknik ini tergantung pada teori pasangan pasangan pelengkap Watson Crick, yang menghasilkan hibrid DNA - DNA atau hibrid DNA - RNA, yang dengan demikian dapat mendeteksi gen yang bermutasi atau dapat mengidentifikasi gen yang diinginkan. Lebih lanjut, teknik ini menggunakan sekuens DNA untai tunggal, sekuens DNA untai ganda, sekuens RNA untai tunggal atau oligonukleotida sintetik yang disiapkan menggunakan terjemahan nick sebagai probe yang saling melengkapi dengan sekuens gen yang menarik. Selain itu, fitur terpenting dari teknik ini adalah pelabelan probe dengan pewarna fluoresensi. Dengan demikian, probe terikat dengan bagian kromosom yang saling melengkapi dan membuatnya mudah untuk dideteksi.

Selain itu, IKAN adalah metode yang sangat sensitif dan spesifik. Oleh karena itu, ini adalah teknik umum dalam penelitian dan diagnosis keganasan hematologis dan tumor padat. Tapi, IKAN menunjukkan resolusi rendah. Ini juga membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang kelainan target untuk merancang urutan penyelidikan.

Gambar 01: IKAN

Ada banyak aplikasi FISH, terutama dalam diagnosa molekuler penyakit menular untuk mengidentifikasi keberadaan patogen dan untuk mengkonfirmasi patogen melalui diagnostik molekuler. Selain itu, IKAN adalah teknik yang umum digunakan di bidang biologi perkembangan, kariotipe dan analisis filogenetik dan pemetaan fisik kromosom.

Apa itu CGH??

Comparative genomic hybridization (CGH) adalah teknik sitogenetik molekuler berbasis DNA yang dapat mendeteksi perubahan sekuens DNA genom. Metode ini adalah metode canggih yang dapat menganalisis modifikasi kromosom dan gen untuk mendeteksi perubahan atau perubahan dalam urutan DNA genom. Lebih lanjut, CGH membutuhkan isolasi dan fragmentasi DNA dari sampel percobaan dan sampel referensi. Kemudian, sampel harus diberi label menggunakan dua pewarna fluorescent yang berbeda (biasanya merah dan hijau). Kemudian, kedua sampel dicampur dan diizinkan untuk hibridisasi kompetitif. Langkah terakhir adalah analisis sampel untuk perubahan dalam DNA seperti duplikasi gen, kehilangan gen, dll. Terutama, itu mengukur perbedaan jumlah salinan DNA antara sampel uji dan sampel kontrol.

Gambar 02: CGH

Versi lain dari CGH tersedia sekarang; itu adalah metode yang lebih maju daripada CGH normal. Ini adalah teknik yang disebut CGH berbasis array atau aCGH. aCGH memungkinkan identifikasi gen atau penghapusan urutan yang tepat dalam ribuan sekuens dalam satu percobaan tunggal.

Apa Persamaan Antara IKAN dan CGH?

• IKAN dan CGH adalah dua teknik molekuler.
• FISH dan CGH bergantung pada hibridisasi asam nukleat.
• Selain itu, kedua teknik ini membutuhkan probe yang dirancang untuk mendeteksi target DNA spesifik.
• Kami menggunakannya untuk diagnosis penyakit genetik pra-natal dan pasca-kelahiran.
• Selain itu, baik FISH maupun CGH adalah alat yang sangat kuat untuk mempelajari perubahan genom.
• Mereka menggunakan pewarna fluoresens untuk melabeli probe.

Apa Perbedaan Antara IKAN dan CGH?

IKAN adalah di situ prosedur hibridisasi yang menggunakan probe fluoresens untuk mendeteksi sekuens DNA spesifik, sedangkan CGH adalah teknik hibridisasi molekuler yang mendeteksi perubahan sekuens DNA genom. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara IKAN dan CGH.

Selain itu, FISH membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang kelainan target untuk merancang urutan penyelidikan, sementara CGH tidak memerlukan pengetahuan sebelumnya. Juga, perbedaan lebih lanjut antara FISH dan CGH adalah bahwa FISH menunjukkan resolusi terbatas sementara aCGH menunjukkan resolusi tinggi.

Infografis di bawah ini merangkum perbedaan antara IKAN dan CGH.

Ringkasan - IKAN vs CGH

FISH dan CGH adalah dua teknik sitogenetik molekuler yang memfasilitasi deteksi urutan gen yang menarik. FISH memfasilitasi deteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresensi sementara CGH memfasilitasi deteksi perubahan dalam genomik DNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara IKAN dan CGH.

Referensi:

1. "Hibridisasi Fluoresensi In Situ (FISH)", Berita Alam, Grup Penerbitan Alam, Tersedia di sini.
2. Hester, Susan D, et al. "Perbandingan Teknologi Hibridisasi Genomik Komparatif di seluruh Platform Microarray." Jurnal Teknik Biomolekul: JBT, Asosiasi Fasilitas Sumberdaya Biomolekul, April 2009, Tersedia di sini.

Gambar milik:

1. "Multiplex ViewRNA FISH Assay di sel Jurkat dan HeLa" Oleh Ryan Jeffs - Pekerjaan sendiri (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Skema CGH" Oleh Mbaudis (bicara) (Unggah) - Pekerjaan sendiri (CC BY 2.5) melalui Commons Wikimedia