Itu perbedaan utama antara ferredoxin dan Rubredoxin adalah itu ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan Rubredoxin.
Baik ferredoxin dan Rubredoxin adalah protein yang mengandung zat besi. Namun, kita dapat menemukan ferredoxin dalam bentuk bakteri dan tanaman karena merupakan protein-kloroplas. Namun, Rubredoxin adalah protein yang hanya terjadi pada bakteri dan archaea. Kedua senyawa ini memiliki struktur yang sangat mirip.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Ferredoxin?
3. Apa itu Rubredoxin
4. Perbandingan Berdampingan - Ferredoxin vs Rubredoxin dalam Bentuk Tabular
5. Ringkasan
Ferredoxin adalah protein yang mengandung besi-sulfur. Ini terlibat dalam memediasi transfer elektron dalam berbagai reaksi metabolisme. Ini adalah protein kecil yang larut dalam air, dan mereka ada di kloroplas. Atom besi dan sulfur dalam protein ini tersusun dalam kelompok besi-sulfur. Mereka dapat bertindak sebagai kapasitor biologis dengan menerima dan melepaskan elektron. Di sini, keadaan oksidasi atom besi berubah dari +2 menjadi +3. Oleh karena itu, mereka bertindak sebagai agen transfer elektron dalam reaksi redoks yang terjadi di lingkungan biologis. Relatif, potensi redoks protein ini rendah. Molekul protein ferredoxin dapat mengandung dua, tiga atau empat atom besi per molekul protein. Ada tiga jenis ferredoxin: Fe2S2 ferredoxins, Fe4S4 ferredoxins dan Fe3S4 ferredoxins.
Peran utama ferredoxin adalah mengalokasikan elektron berenergi tinggi dalam kloroplas, dan protein ini terlibat dalam mendistribusikan elektron yang diperlukan untuk fiksasi karbon dioksida, reduksi nitril, reduksi sulfit, sintesis glutamat, aliran elektron siklik, dll..
Rubredoxin adalah protein yang mengandung zat besi yang dapat ditemukan pada bakteri dan archaea. Ini adalah jenis protein dengan berat molekul rendah (biasanya protein adalah senyawa dengan berat molekul tinggi). Namun, tidak seperti ferredoxin, protein Rubredoxin tidak mengandung sulfida anorganik. Peran utama Rubredoxin adalah berpartisipasi dalam mekanisme transfer elektron dalam reaksi redoks yang terjadi dalam sistem biologis.
Ketika mempertimbangkan struktur Rubredoxin, mengandung atom besi pusat yang hampir memiliki geometri tetrahedral. Empat kelompok yang terikat pada atom besi ini adalah residu sistein. Mayoritas protein Rubredoxin adalah spesies kimia yang larut dalam air. Namun, ada beberapa spesies yang tidak larut yang ada sebagai protein yang terikat membran. Misalnya. Rubredoxin-A.
Selama mekanisme transfer elektron, keadaan oksidasi atom besi pusat berubah dari +2 menjadi +3. Kita dapat dengan mudah mengenali perubahan ini dalam keadaan oksidasi karena warnanya berubah dari merah menjadi tidak berwarna. Selama perubahan ini, ion logam tetap dalam keadaan putaran tinggi karena sangat membantu untuk meminimalkan perubahan struktural protein. Biasanya, potensi reduksi Rubredoxin lebih tinggi dari ferredoxin; berada dalam kisaran +50 mV hingga -50 mV.
Ferredoxin dan Rubredoxin adalah senyawa protein yang mengandung besi dan sulfur sebagai komponen. Perbedaan utama antara ferredoxin dan Rubredoxin adalah bahwa ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan Rubredoxin. Potensi redoks dari ferredoxin sekitar -420 mV, dan potensi redoks Rubredoxin berkisar dari -50 hingga +50 mV. Lebih lanjut, ferredoxin dapat mengandung dua, tiga atau empat atom besi per molekul protein, tetapi dalam Rubredoxin, ada satu atom besi pusat. Namun, kedua molekul ini memiliki geometri tetrahedral yang sangat mirip di sekitar atom besi.
Selain itu, ferredoxin mengandung sulfur anorganik sebagai komponen dalam molekul protein, tetapi tidak ada sulfur anorganik dalam Rubredoxin. Ketika mempertimbangkan kejadian tersebut, ferredoxin dapat terjadi baik dalam bentuk bakteri maupun pada tanaman, tetapi Rubredoxin terjadi pada bakteri dan archaea.
Tabulasi di bawah ini merangkum perbedaan antara ferredoxin dan Rubredoxin.
Ferredoxin dan Rubredoxin adalah senyawa protein yang mengandung besi dan sulfur sebagai komponen. Perbedaan utama antara ferredoxin dan Rubredoxin adalah bahwa ferredoxin memiliki potensi redoks yang jauh lebih rendah dibandingkan dengan Rubredoxin.
1. Chipperfield, J.r. “BESI | Properti dan Penentuan. " Ensiklopedia Ilmu dan Nutrisi Makanan, 2003, hlm. 3367-3373., Doi: 10.1016 / b0-12-227055-x / 00650-7.
1. “3P1M.pdb1” Oleh tim Pengembangan Jmol - Jmol (CC0) via Commons Wikimedia
2. "PDB 1s24 EBI" Oleh Jawahar Swaminathan dan staf MSD di European Bioinformatics Institute - (Public Domain) melalui Commons Wikimedia