Itu perbedaan utama antara DNA dan cDNA adalah bahwa DNA mengandung ekson dan intron sementara cDNA hanya berisi ekson.
DNA dan cDNA adalah dua jenis asam nukleat yang terdiri dari deoksiribonukleotida. DNA adalah salah satu makromolekul terpenting dari organisme hidup yang membuat genom. Genom berisi informasi genetik keseluruhan dari suatu organisme. Ini merupakan berbagai jenis urutan termasuk ekson yang merupakan urutan pengkodean dan intron yang merupakan urutan non-pengkodean. Di sisi lain, cDNA atau DNA komplementer adalah bentuk lain dari DNA yang disintesis secara buatan dari molekul mRNA oleh para ilmuwan. Karena cDNA berasal dari templat mRNA, cDNA tidak mengandung urutan atau intron non-coding.
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu DNA
3. Apa itu cDNA
4. Kesamaan Antara DNA dan cDNA
5. Perbandingan Berdampingan - DNA vs cDNA dalam Bentuk Tabular
6. Ringkasan
Asam deoksiribonukleat atau DNA berfungsi sebagai bahan genetik dari banyak organisme hidup termasuk bakteri. Informasi genetik berada di dalam molekul DNA dalam bentuk urutan nukleotida dan gen. Selama reproduksi, DNA orangtua mentransmisikan ke generasi keturunan melalui gamet. Secara struktural, DNA adalah makromolekul yang tersusun atas monomer deoksiribonukleotida. Deoksiribonukleotida memiliki tiga komponen; gula deoksiribosa, basa nitrogen (adenin, guanin, sitosin, dan timin) dan gugus fosfat. Selanjutnya, molekul DNA ada sebagai heliks ganda yang terbuat dari dua untai DNA komplementer yang dihubungkan oleh ikatan hidrogen antara basa nitrogen komplementer. Oleh karena itu, ada dua ikatan hidrogen antara adenin dan timin, sementara ada tiga ikatan hidrogen antara sitosin dan guanin..
Gambar 01: DNA
Dalam heliks DNA, gugus fosfat dan gula berada di luar heliks sementara basa tetap di bagian dalam heliks. Dua untai DNA berjalan berlawanan arah. Lebih jauh, molekul DNA secara erat berliku dengan protein histon dan membuat struktur seperti benang yang disebut kromosom pada eukariota. Sifat penting dari DNA adalah ia dapat bereplikasi sendiri, yang berarti dapat mereplikasi atau membuat salinannya sendiri. Ini juga memiliki peran utama dalam sintesis protein organisme hidup.
cDNA adalah singkatan dari DNA komplementer. Ini adalah bentuk DNA yang disintesis secara artifisial oleh messenger RNA (mRNA) yang berfungsi sebagai templat di hadapan enzim reverse transcriptase. Dalam kebanyakan eukariota, DNA genom mengandung banyak gen yang terdiri dari ekson dan intron. Exon adalah urutan pengkodean sementara intron membuat bagian non-coding genom. Secara umum, selama ekspresi gen, urutan DNA merasakan transkripsi menjadi urutan mRNA sebelum menghasilkan protein. Saat membuat mRNA yang matang, mekanisme splicing menghilangkan semua urutan intron. Oleh karena itu, mRNA dewasa tidak mengandung intron atau sekuens non-coding.
Selain itu, mRNA sel eukariotik dapat diekstraksi dan dimurnikan untuk membuat cDNA. Enzim; reverse transcriptase mengkatalisasi sintesis cDNA dari mRNA eukariotik murni ini. Setelah membangun cDNA dari mRNA, mereka kemudian dapat dikloning ke dalam sel bakteri untuk membuat perpustakaan cDNA atau dapat digunakan untuk melakukan studi ekspresi heterolog.
Gambar 02: cDNA
Biasanya, cDNA memiliki nilai besar dalam kloning gen eukariotik pada prokariota. Karena prokariota tidak mengandung intron, mereka tidak dapat memotong intron dari DNA eukariotik dan membuat mRNA fungsional. Oleh karena itu, sebelum mengkloning seluruh gen eukariotik ke dalam prokariota, perlu untuk menghilangkan intron dan membuat cDNA dari mRNA dan mengkloning menjadi prokariota.
DNA adalah bentuk alami asam nukleat sementara cDNA adalah bentuk asam nukleat yang dibuat secara buatan. Oleh karena itu, ini adalah satu perbedaan antara DNA dan cDNA. Terlebih lagi, DNA mewakili genom dari banyak organisme hidup. Ini menyusun urutan coding dan non-coding. Namun, ketika membuat mRNA, semua urutan intron dikeluarkan karena mereka tidak penting untuk pembentukan protein. Oleh karena itu, urutan mRNA tidak mengandung intron. Urutan mRNA ini bertindak sebagai templat ketika mensintesis cDNA. Karenanya, cDNA tidak mengandung intron. Dengan demikian, DNA mengandung intron, tetapi cDNA tidak mengandung intron. Kita dapat mengatakan ini sebagai perbedaan utama antara DNA dan cDNA.
Lebih jauh, karena cDNA hanya mengandung ekson, cDNA jauh lebih pendek dari DNA. DNA mengandung beberapa intron yang menjangkau ribuan pasangan basa. Jadi, ini juga perbedaan antara DNA dan cDNA. Selain itu, DNA secara alami terjadi sebagai heliks beruntai ganda sementara cDNA terjadi sebagai urutan untai tunggal. DNA polimerase adalah enzim yang mengkatalisasi sintesis DNA atau replikasi sedangkan reverse transcriptase adalah enzim yang mengkatalisasi sintesis cDNA di laboratorium.
Infografis di bawah tentang perbedaan antara DNA dan cDNA memberikan rincian lebih lanjut tentang perbedaan ini.
DNA adalah polimer penting yang membuat genom kita. Di sisi lain, cDNA adalah bentuk lain dari DNA yang penting untuk membuat perpustakaan cDNA dan menghasilkan protein yang sulit diekspresikan. mRNA digunakan untuk membuat cDNA. Karenanya, cDNA tidak mengandung intron. Tetapi DNA mengandung intron. Jadi, itu adalah perbedaan utama antara DNA dan cDNA. DNA berguna untuk membangun perpustakaan DNA genom sementara cDNA berguna untuk membangun perpustakaan cDNA. Karena cDNA tidak mengandung intron, cDNA lebih pendek dari DNA. Yang paling penting, DNA beruntai ganda, sedangkan cDNA beruntai tunggal. Ini merangkum perbedaan antara DNA dan cDNA.
1. "DNA komplementer." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 7 Des. 2018. Tersedia di sini
2. “Apa Itu DNA? - Referensi Rumah Tangga Genetika - NIH. " Perpustakaan Kedokteran Nasional A.S., Institut Kesehatan Nasional. Tersedia disini
1. "Eukaryote DNA-en" Oleh Magnus Manske, Dietzel65, LadyofHats, Radio89 (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Pembentukan Perpustakaan cDNA" Oleh PhD Dre (CC BY-SA 3.0) melalui Commons Wikimedia