Perbedaan Antara Berjalan dan Melompat Kromosom

Perbedaan Kunci - Berjalan Kromosom vs Melompat

Berjalan kromosom dan lompatan kromosom adalah dua alat teknis yang digunakan dalam biologi molekuler untuk menemukan gen pada kromosom dan pemetaan fisik genom. Berjalan kromosom adalah teknik yang digunakan untuk mengkloning gen target di perpustakaan genom dengan cara isolasi berulang dan kloning klon yang berdekatan dari perpustakaan genom.. Melompat kromosom adalah versi khusus dari berjalan kromosom yang mengatasi breakpoints dari berjalan kromosom. Berjalan kromosom hanya dapat mengurutkan dan memetakan kromosom yang berukuran kecil sementara melompat kromosom memungkinkan pengurutan sebagian besar kromosom. Ini adalah perbedaan utama antara berjalan kromosom dan melompat kromosom.

ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Utama
2. Apa itu Berjalan Kromosom
3. Apa itu Jumping Kromosom
4. Perbandingan Berdampingan - Berjalan Kromosom vs Melompat
5. Ringkasan

Apa itu Berjalan Kromosom?

Berjalan kromosom adalah alat yang mengeksplorasi daerah urutan kromosom yang tidak diketahui dengan menggunakan fragmen restriksi yang tumpang tindih. Dalam berjalan kromosom, bagian dari gen yang diketahui digunakan sebagai probe dan dilanjutkan dengan mengkarakterisasi panjang kromosom yang akan dipetakan atau diurutkan. Ini bergerak dari penanda ke panjang target. Dalam kromosom berjalan, ujung setiap fragmen yang tumpang tindih digunakan untuk hibridisasi untuk mengidentifikasi urutan berikutnya.

Probe disiapkan dari potongan DNA kloning dan disubklon. Kemudian mereka digunakan untuk menemukan fragmen yang tumpang tindih berikutnya. Semua urutan yang tumpang tindih ini digunakan untuk menyusun peta genetik kromosom dan menemukan gen target. Ini adalah metode menganalisis bentangan panjang DNA dengan potongan-potongan kecil yang tumpang tindih dari perpustakaan genom yang direkontruksi..

Teknik Berjalan Kromosom - Langkah

Isolasi sebuah fragmen DNA yang berisi gen yang dikenal atau penanda dekat gen target
Persiapan peta restriksi fragmen yang dipilih dan subkloning wilayah ujung fragmen untuk digunakan sebagai probe
Hibridisasi probe dengan fragmen yang tumpang tindih berikutnya
Persiapan peta restriksi fragmen 1 dan subkloning daerah ujung fragmen 1 untuk digunakan sebagai penyelidikan untuk identifikasi fragmen yang tumpang tindih berikutnya.
Hibridisasi probe dengan fragmen yang tumpang tindih 2
Persiapan peta restriksi fragmen 2 dan subkloning wilayah ujung fragmen 2 untuk berfungsi sebagai penyelidikan untuk identifikasi fragmen yang tumpang tindih berikutnya

Langkah-langkah di atas harus dilanjutkan sampai gen target atau hingga 3 'akhir dari total panjang urutan.

Gambar 01: Teknik Berjalan Kromosom

Berjalan kromosom merupakan aspek penting dari sitogenetik dalam menemukan SNP dari banyak organisme dan menganalisis penyakit yang ditularkan secara genetis dan menemukan mutasi gen yang relevan.

Apa itu Jumping Kromosom?

Melompat kromosom adalah teknik yang digunakan dalam biologi molekuler untuk pemetaan fisik genom organisme. Teknik ini diperkenalkan untuk mengatasi penghalang berjalan kromosom yang muncul setelah menemukan daerah DNA berulang selama proses kloning. Oleh karena itu, teknik lompatan kromosom dapat dianggap sebagai versi khusus dari berjalan kromosom. Ini adalah metode cepat dibandingkan dengan berjalan kromosom dan memungkinkan melewati sekuens DNA berulang yang tidak mudah dikloning selama berjalan kromosom. Lompatan kromosom mempersempit celah antara gen target dan penanda yang diketahui tersedia untuk pemetaan genom.

Alat lompatan kromosom dimulai dengan pemotongan DNA spesifik dengan restriksi endonuklease khusus dan ligasi fragmen menjadi loop sirkularisasi. Kemudian primer yang dirancang dari urutan yang diketahui digunakan untuk mengurutkan lingkaran yang diedarkan. Primer ini memungkinkan lompatan dan pengurutan secara alternatif. Oleh karena itu, ia dapat melewati sekuens DNA berulang dan berjalan cepat melalui kromosom untuk mencari gen target.

Penemuan gen yang dikode untuk penyakit fibrosis kistik dilakukan dengan menggunakan alat lompat kromosom. Dikombinasikan bersama, melompat dan berjalan kromosom dapat meningkatkan proses pemetaan genom.

Gambar 02: Jumping Kromosom

Apa perbedaan antara Berjalan Kromosom dan Melompat?

Berjalan Kromosom vs Melompat
Kromosom adalah alat yang digunakan dalam biologi molekuler untuk memetakan genom dan menemukan gen tertentu.	Jumping kromosom adalah alat yang digunakan untuk pemetaan fisik genom dan penemuan cepat gen target dalam kromosom.
Panjang Sequencing Perbandingan
Hanya fragmen kecil yang dapat dikloning dengan berjalan kromosom.	Panjang kromosom yang lebih besar dapat dipetakan oleh lompatan kromosom.
Kloning DNA Berulang dalam Kromosom
Teknik berjalan kromosom memiliki kesulitan dalam berjalan melalui urutan DNA berulang yang ditemukan dalam kromosom.	Ini memungkinkan melewati sekuens DNA berulang. Oleh karena itu tidak ada kesulitan ketika menemukan mereka selama pengurutan.
Faktor-Faktor yang Mempengaruhi Proses
Keberhasilan proses tergantung pada ukuran genom dan jarak yang harus "berjalan" dari posisi genom yang diketahui menuju gen yang diinginkan..	Keberhasilan tidak tergantung pada ukuran genom jarak dari penanda ke target.
Efek DNA Tidak Dikloning
Berjalan kromosom dapat dihentikan oleh fragmen DNA yang tidak dikloning.	Catatan terendah yang dapat dimainkan piccolos adalah D_4.
Kebutuhan untuk Urutan yang Dikenal
Prosesnya dimulai dengan gen yang dikenal dekat target.	Proses ini membutuhkan fragmen yang dikenal untuk mendesain primer.

Ringkasan - Berjalan Kromosom vs Melompat

Berjalan kromosom sering diterapkan ketika diketahui bahwa gen tertentu terletak di dekat gen yang dikloning sebelumnya dalam kromosom dan dimungkinkan untuk mengidentifikasi dengan isolasi berulang klon genom yang berdekatan dari perpustakaan genom. Namun, ketika daerah DNA berulang ditemukan selama teknik berjalan kromosom, proses tidak dapat dilanjutkan. Oleh karena itu, tekniknya pecah dari titik itu. Melompat kromosom adalah alat biologis molekuler yang mengatasi keterbatasan ini untuk memetakan genom. Ini melewati daerah DNA berulang yang sulit dikloning dan membantu dalam pemetaan fisik genom. Inilah perbedaan utama antara kromosom berjalan dan melompat.

Referensi:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa, dan Mitsuhiro Yanagida. "Berjalan kromosom menunjukkan urutan berulang yang sangat homolog hadir di semua daerah sentromer ragi fisi." Jurnal EMBO. Perpustakaan Kedokteran Nasional A.S., Mei 1986. Web. 22 Maret 2017
2. Taheri, Ali. "Kromosom berjalan dan melompat." Kemajuan dalam Rekayasa Genetika. OMICS International, 30 Oktober 2013. Web. 22 Maret 2017

Sains & Alam